23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0010 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0010  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.642715  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00011  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  480  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3585  protein of unknown function UPF0174  99.58 
 
 
237 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00011  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  480  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0012  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0011  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0012  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.242726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0011  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3644  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0010  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0202252  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0010  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0398298  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0010  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.503351  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0010  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0010  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0936  hypothetical protein  33.06 
 
 
252 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.792793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003217  hypothetical protein  32.78 
 
 
251 aa  114  1e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03360  hypothetical protein  32.99 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.16345e-12  unclonable  5.57606e-22 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0937  hypothetical protein  27.67 
 
 
248 aa  78.6  8e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03370  hypothetical protein  27.87 
 
 
332 aa  78.2  9e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.62084e-12  unclonable  6.16772e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1808  hypothetical protein  27.16 
 
 
235 aa  72.4  6e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4801  hypothetical protein  30.39 
 
 
273 aa  71.6  1e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.472026  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3728  hypothetical protein  27.54 
 
 
475 aa  54.3  2e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3598  hypothetical protein  29.37 
 
 
280 aa  49.3  6e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>