More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0007 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  99.37 
 
 
317 aa  646  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  99.68 
 
 
317 aa  647  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  100 
 
 
338 aa  693  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  99.37 
 
 
317 aa  646  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  99.68 
 
 
317 aa  647  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  99.37 
 
 
317 aa  646  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  99.37 
 
 
317 aa  646  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  99.37 
 
 
317 aa  646  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  99.7 
 
 
338 aa  692  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  94.95 
 
 
317 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  94.95 
 
 
317 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  94.95 
 
 
317 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  94.95 
 
 
317 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  95.58 
 
 
317 aa  627  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  94.64 
 
 
317 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  90.22 
 
 
317 aa  601  1e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  90.85 
 
 
317 aa  601  1e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  89.59 
 
 
317 aa  597  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  88.33 
 
 
317 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  89.27 
 
 
317 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  88.64 
 
 
317 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  88.64 
 
 
317 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  89.59 
 
 
317 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  77 
 
 
317 aa  511  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  75.16 
 
 
316 aa  484  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  72.87 
 
 
316 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  73.48 
 
 
316 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  72.59 
 
 
319 aa  468  1e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  72.2 
 
 
318 aa  464  1e-130  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  74.12 
 
 
316 aa  465  1e-130  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  72.52 
 
 
318 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  71.57 
 
 
318 aa  458  1e-128  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  71.57 
 
 
318 aa  458  1e-128  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.40039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  72.84 
 
 
316 aa  458  1e-128  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  71.88 
 
 
318 aa  460  1e-128  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  68.04 
 
 
320 aa  458  1e-128  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  72.2 
 
 
318 aa  460  1e-128  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  71.88 
 
 
318 aa  459  1e-128  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.61015e-05  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  71.25 
 
 
318 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  71.25 
 
 
318 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  71.25 
 
 
318 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.75704e-05  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  70.93 
 
 
317 aa  453  1e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  70.61 
 
 
317 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  69.72 
 
 
316 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  70.35 
 
 
318 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  69.72 
 
 
319 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  68.37 
 
 
317 aa  445  1e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  69.65 
 
 
317 aa  445  1e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  68.77 
 
 
318 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  67.82 
 
 
318 aa  439  1e-122  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.01503e-07  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  67.19 
 
 
316 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.43642e-07  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  65.06 
 
 
316 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  64.74 
 
 
316 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  64.42 
 
 
316 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  64.1 
 
 
316 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  62.22 
 
 
316 aa  417  1e-115  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  61.22 
 
 
316 aa  415  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  61.22 
 
 
316 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  64.76 
 
 
310 aa  407  1e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.65093e-10  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  63.67 
 
 
316 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  62.82 
 
 
316 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  63.14 
 
 
316 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  63.67 
 
 
316 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  63.34 
 
 
316 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  61.78 
 
 
322 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  61.78 
 
 
322 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0076  transaldolase A  56.96 
 
 
317 aa  384  1e-105  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  58.68 
 
 
321 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  60.06 
 
 
318 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  61.34 
 
 
308 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  60.95 
 
 
308 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  60.88 
 
 
308 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  60.7 
 
 
309 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  60.25 
 
 
308 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  60.97 
 
 
307 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  60.44 
 
 
313 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  60.88 
 
 
308 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  2.13936e-05 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  59.42 
 
 
321 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  56.19 
 
 
316 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  59.74 
 
 
321 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  57.59 
 
 
326 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0645  transaldolase B  60.65 
 
 
316 aa  362  7e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.02 
 
 
390 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.26 
 
 
390 aa  358  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  57.01 
 
 
339 aa  357  2e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3045  transaldolase B  56.74 
 
 
329 aa  355  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.86 
 
 
392 aa  355  6e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.7 
 
 
390 aa  355  7e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  54.92 
 
 
324 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  56.92 
 
 
389 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  57.99 
 
 
319 aa  352  6e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  57.32 
 
 
397 aa  351  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  59.87 
 
 
315 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>