More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0006 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00007  predicted transporter  99.16 
 
 
476 aa  953  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3648  amino acid carrier protein  99.16 
 
 
476 aa  953  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0008  amino acid carrier protein  98.74 
 
 
476 aa  946  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00007  hypothetical protein  99.16 
 
 
476 aa  953  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  76.47 
 
 
485 aa  748  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  76.47 
 
 
485 aa  748  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0007  amino acid carrier protein  98.53 
 
 
476 aa  946  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  76.68 
 
 
485 aa  750  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  76.47 
 
 
485 aa  751  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0569  amino acid carrier protein  74.16 
 
 
476 aa  681  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.352189  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  76.26 
 
 
476 aa  746  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0008  amino acid carrier protein  98.95 
 
 
476 aa  951  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.876133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3589  amino acid carrier protein  99.37 
 
 
476 aa  954  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0006  amino acid carrier protein  100 
 
 
476 aa  958  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0007  amino acid carrier protein  98.74 
 
 
476 aa  949  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.665719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  50.31 
 
 
494 aa  505  1e-142  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  51.69 
 
 
476 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.92586e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  50.63 
 
 
477 aa  498  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  54.32 
 
 
474 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  49.9 
 
 
477 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  51.61 
 
 
471 aa  471  1e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  51.39 
 
 
471 aa  468  1e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  49.02 
 
 
489 aa  459  1e-128  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
488 aa  446  1e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  47.02 
 
 
480 aa  447  1e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.10867e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  48.83 
 
 
481 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  46.32 
 
 
480 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
480 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
480 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  47.48 
 
 
493 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
488 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  48.51 
 
 
480 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  48.94 
 
 
488 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  48.94 
 
 
488 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  46.28 
 
 
470 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  48.51 
 
 
480 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2575  amino acid carrier protein  45.99 
 
 
471 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  48.82 
 
 
483 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  46.93 
 
 
502 aa  416  1e-115  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.71022e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  47.96 
 
 
504 aa  416  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.65436e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  46.57 
 
 
498 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  46.09 
 
 
485 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.00083e-05  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3565  amino acid carrier protein  49.38 
 
 
481 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  44.19 
 
 
472 aa  399  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
468 aa  401  1e-110  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  44.19 
 
 
472 aa  399  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  46.72 
 
 
493 aa  399  1e-110  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  46.34 
 
 
492 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.31923e-07  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02218  putative amino acid permease  43.76 
 
 
468 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00221678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  42.89 
 
 
502 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  44.33 
 
 
470 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.67507e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.26 
 
 
478 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  44.59 
 
 
471 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1842  amino acid carrier protein  44.93 
 
 
468 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  43.01 
 
 
477 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  45.96 
 
 
458 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  43.76 
 
 
480 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.96043e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  43.99 
 
 
497 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  43.76 
 
 
480 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.59546e-08  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  43.4 
 
 
479 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  43.34 
 
 
479 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.46117e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  42.98 
 
 
480 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.72826e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0483  amino acid carrier family protein  42.8 
 
 
477 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  43.19 
 
 
479 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  44.19 
 
 
481 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.79822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  43.55 
 
 
479 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.93697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  43.55 
 
 
479 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.79263e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  42.55 
 
 
503 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  42.71 
 
 
479 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.09666e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  44.18 
 
 
466 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  4.74691e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  43.52 
 
 
495 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  43.78 
 
 
497 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  43.13 
 
 
479 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  5.61362e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  43.1 
 
 
483 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  43.13 
 
 
496 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  43.78 
 
 
497 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  42.49 
 
 
504 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  42.34 
 
 
503 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  42.34 
 
 
503 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  42.49 
 
 
504 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 
476 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.60779e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  42.34 
 
 
503 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  42.34 
 
 
503 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  42.34 
 
 
503 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  40.63 
 
 
476 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  9.91647e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  40.84 
 
 
476 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.01461e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  40.84 
 
 
476 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.37228e-08  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  40.63 
 
 
476 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.04264e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  42.67 
 
 
483 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  40.63 
 
 
476 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.12742e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  40.63 
 
 
476 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.31766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  43.74 
 
 
466 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  42.34 
 
 
503 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  42.34 
 
 
503 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  43.64 
 
 
457 aa  368  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  41.65 
 
 
477 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  42.35 
 
 
485 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  41.65 
 
 
477 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  40.21 
 
 
476 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.29294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  42.95 
 
 
479 aa  362  6e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>