More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4599 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3631  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00452114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4599  DNA-binding transcriptional activator BglJ  100 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5879  DNA-binding transcriptional activator BglJ  100 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0356322  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4960  DNA-binding transcriptional activator BglJ  99.56 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4912  DNA-binding transcriptional activator BglJ  99.11 
 
 
225 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000035455  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04243  DNA-binding transcriptional activator  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0432345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04209  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3689  DNA-binding transcriptional activator BglJ  99.52 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.256974  decreased coverage  0.00000689885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4869  DNA-binding transcriptional activator BglJ  63.18 
 
 
224 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0232651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4962  DNA-binding transcriptional activator BglJ  63.18 
 
 
224 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4801  DNA-binding transcriptional activator BglJ  63.18 
 
 
224 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.564373  normal  0.609809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4904  DNA-binding transcriptional activator BglJ  63.18 
 
 
224 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.53459  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4956  DNA-binding transcriptional activator BglJ  63.18 
 
 
224 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  49.48 
 
 
211 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  31.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  26.51 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  29.68 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  30.63 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  26.7 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  25.3 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  25.3 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  29.41 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  33.03 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  31.61 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  32.74 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  48.15 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  31.86 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  36.36 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  31.86 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  49.02 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  31.86 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.02 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  49.09 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  49.09 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.07 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  46.43 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  47.27 
 
 
220 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 
218 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  37.68 
 
 
214 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2879  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  26 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  37.68 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4886  putative GerE family regulatory protein  38.57 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0810  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.97 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.75 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.09 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  43.48 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  28.74 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  47.27 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>