32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4531 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  87.79 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  62.88 
 
 		 436 aa  337  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  43.8 
 
 		 429 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  41.64 
 
 		 438 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  90.65 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  34.6 
 
 		 416 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  31.8 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  35.77 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  32.08 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  32.45 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  30.94 
 
 		 418 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  30.08 
 
 		 445 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  32.31 
 
 		 431 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  30.36 
 
 		 435 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  28.75 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  27.05 
 
 		 443 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  27.87 
 
 		 445 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  26.91 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  30 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  27.48 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.59 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  29.03 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  26.44 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.06 
 
 		 383 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  25.93 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0972  hypothetical protein  28.28 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.241373 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  25.4 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.85 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.17 
 
 		 460 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  22.71 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.52 
 
 		 431 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>