130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4379 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  100 
 
 
433 aa  859    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  99.77 
 
 
433 aa  857    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  859    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 
433 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
433 aa  859    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  99.77 
 
 
433 aa  858    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
433 aa  859    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  87.76 
 
 
433 aa  724    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 
433 aa  709    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  84.99 
 
 
433 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
433 aa  859    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
433 aa  859    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
433 aa  859    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4686  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  94.69 
 
 
433 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  94.69 
 
 
433 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  94.69 
 
 
433 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  94.69 
 
 
433 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  94.69 
 
 
433 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  63.59 
 
 
433 aa  550  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  61.52 
 
 
433 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  61.75 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  61.75 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  63.36 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  61.75 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  65.67 
 
 
433 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  63.36 
 
 
433 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  61.3 
 
 
415 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  61.98 
 
 
433 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  65.25 
 
 
433 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.57 
 
 
435 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0644  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  61.56 
 
 
415 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  53.04 
 
 
497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.83 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1644  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.47 
 
 
445 aa  462  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1910  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  55.58 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0126461  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04830  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  61.52 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.664542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1117  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.38 
 
 
444 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1912  hypothetical protein  52.37 
 
 
446 aa  434  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000048049  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0390  IspD/IspF bifunctional enzyme  53.41 
 
 
447 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.889279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002213  C4-dicarboxylate transporter anaerobic  55.5 
 
 
435 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2271  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.73 
 
 
435 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00155  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.73 
 
 
435 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0083  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
442 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0123  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.39 
 
 
442 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0139  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.13 
 
 
444 aa  393  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0095  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  53.62 
 
 
442 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  46.5 
 
 
441 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1089  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.98 
 
 
432 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  45.98 
 
 
433 aa  352  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.98 
 
 
437 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.29 
 
 
437 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.06 
 
 
437 aa  325  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.52 
 
 
437 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2005  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.96 
 
 
433 aa  325  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.29 
 
 
437 aa  325  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.06 
 
 
437 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.06 
 
 
437 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.29 
 
 
437 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.06 
 
 
437 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.06 
 
 
437 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.38 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.96 
 
 
453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0209  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  45.89 
 
 
423 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.52 
 
 
453 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.63 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  39.95 
 
 
441 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.57 
 
 
439 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  41.53 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.91 
 
 
437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  40.09 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.35 
 
 
439 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.35 
 
 
439 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.35 
 
 
439 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.38 
 
 
436 aa  299  6e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.86 
 
 
439 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.4 
 
 
443 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  36.4 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.63 
 
 
442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.73 
 
 
441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.86 
 
 
447 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.69 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.03 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  39.69 
 
 
440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.37 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.39 
 
 
438 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.97 
 
 
447 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.53 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.66 
 
 
441 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.53 
 
 
447 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.53 
 
 
447 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.53 
 
 
447 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.75 
 
 
447 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.43 
 
 
447 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.81 
 
 
447 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.43 
 
 
447 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.26 
 
 
443 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.17 
 
 
443 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.39 
 
 
447 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  37.05 
 
 
446 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.16 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>