More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4355 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  99.55 
 
 
445 aa  877    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  93.93 
 
 
445 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  93.93 
 
 
445 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  93.71 
 
 
445 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  86.85 
 
 
444 aa  778    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  86.62 
 
 
444 aa  776    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  86.85 
 
 
444 aa  778    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  99.78 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  100 
 
 
445 aa  880    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  93.93 
 
 
445 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  93.93 
 
 
445 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  57.51 
 
 
508 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  57.28 
 
 
510 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  57.11 
 
 
508 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  57.28 
 
 
509 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  49.53 
 
 
450 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  39.08 
 
 
443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  39.08 
 
 
443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  39.08 
 
 
443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  39.08 
 
 
443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  39.08 
 
 
443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  40.09 
 
 
449 aa  309  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002188  lysine/cadaverine antiporter membrane protein CadB  39.33 
 
 
447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000189693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  38.6 
 
 
448 aa  302  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  38.53 
 
 
438 aa  300  5e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000705878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04003  predicted lysine/cadaverine transporter  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4687  lysine/cadaverine antiporter  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5648  lysine/cadaverine antiporter  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.742778  normal  0.745814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4601  lysine/cadaverine antiporter  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000619747  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03965  hypothetical protein  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3895  lysine/cadaverine antiporter  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4373  lysine/cadaverine antiporter  38.78 
 
 
444 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0915774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2657  lysine/cadaverine antiporter  39.02 
 
 
445 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  38.55 
 
 
444 aa  289  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  38.78 
 
 
451 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  39.59 
 
 
451 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  34.48 
 
 
452 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  36.69 
 
 
442 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 
750 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396159 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  36.7 
 
 
439 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  35.13 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  36.19 
 
 
439 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  36.19 
 
 
439 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  36.19 
 
 
439 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  36.19 
 
 
439 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  35.61 
 
 
439 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  36.1 
 
 
439 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  35.61 
 
 
439 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  35.37 
 
 
439 aa  266  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  35.78 
 
 
439 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  34.52 
 
 
436 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  33.41 
 
 
439 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  33.41 
 
 
439 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  33.41 
 
 
439 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  33.41 
 
 
439 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  35.41 
 
 
439 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  33.41 
 
 
439 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  35.38 
 
 
438 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  34.89 
 
 
443 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  34.1 
 
 
437 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  32.95 
 
 
439 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  32.72 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  32.72 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  32.72 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  32.72 
 
 
439 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  32.49 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4355  putrescine transporter  36.1 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4011  putrescine transporter  36.1 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3513  putrescine transporter  36.25 
 
 
461 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  32.49 
 
 
439 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  32.54 
 
 
436 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  32.54 
 
 
436 aa  249  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  35.37 
 
 
446 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  36.15 
 
 
476 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  36.83 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  34.1 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  32.45 
 
 
441 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  32.59 
 
 
440 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 
435 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 
436 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  30.73 
 
 
411 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  30 
 
 
447 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  30.7 
 
 
465 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  29.9 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  30.25 
 
 
465 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  30.47 
 
 
465 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  30.47 
 
 
465 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  30.45 
 
 
465 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  30.45 
 
 
465 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  30.47 
 
 
465 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  30.47 
 
 
465 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  31.39 
 
 
475 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>