178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4208 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03855  pantothenate kinase  100 
 
 
316 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03808  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000563828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4016  pantothenate kinase  100 
 
 
308 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000159938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5439  pantothenate kinase  100 
 
 
308 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000280895  hitchhiker  0.000759717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4462  pantothenate kinase  99.68 
 
 
316 aa  649    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4208  pantothenate kinase  100 
 
 
316 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4422  pantothenate kinase  99.68 
 
 
316 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298887  hitchhiker  0.0000844896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4513  pantothenate kinase  100 
 
 
316 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4046  pantothenate kinase  100 
 
 
308 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221747  hitchhiker  0.00101624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4382  pantothenate kinase  95.57 
 
 
316 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000669891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4472  pantothenate kinase  95.57 
 
 
316 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000380876  hitchhiker  0.0000000000000312054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4469  pantothenate kinase  95.57 
 
 
316 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00581383  hitchhiker  0.00102546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4350  pantothenate kinase  95.57 
 
 
316 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000140084  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4547  pantothenate kinase  95.57 
 
 
316 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000536563  hitchhiker  0.0000000000433914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0189  pantothenate kinase  90.51 
 
 
323 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00328017  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  85.76 
 
 
316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  85.76 
 
 
316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  85.76 
 
 
316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0202  pantothenate kinase  83.86 
 
 
316 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0973579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0196  pantothenate kinase  84.18 
 
 
316 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  82.59 
 
 
316 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  82.91 
 
 
316 aa  554  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  81.33 
 
 
316 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  64.31 
 
 
375 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  62.66 
 
 
307 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0196  pantothenate kinase  61.27 
 
 
317 aa  401  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000216211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  60.52 
 
 
319 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3622  pantothenate kinase  58.69 
 
 
322 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  61.39 
 
 
316 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0215  pantothenate kinase  61.97 
 
 
316 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4071  pantothenate kinase  59.49 
 
 
316 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.031551  normal  0.150968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  61.97 
 
 
316 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4173  pantothenate kinase  59.49 
 
 
316 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000219645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  59.49 
 
 
316 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  63.19 
 
 
287 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  60.13 
 
 
316 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  59.49 
 
 
316 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0183  pantothenate kinase  61.31 
 
 
316 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000066395  normal  0.0569679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  61.31 
 
 
316 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  60.98 
 
 
316 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  61.31 
 
 
316 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  58.44 
 
 
312 aa  377  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  59.55 
 
 
315 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  60.98 
 
 
316 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  59.67 
 
 
316 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2526  pantothenate kinase  58.12 
 
 
318 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  58.36 
 
 
314 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  57.19 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0120  pantothenate kinase  56.33 
 
 
318 aa  354  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.132558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1229  pantothenate kinase  54.49 
 
 
326 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978811  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  53.09 
 
 
316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2875  pantothenate kinase  56.82 
 
 
307 aa  352  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  54.57 
 
 
317 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2547  pantothenate kinase  54.05 
 
 
358 aa  352  7e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0140  pantothenate kinase  55.84 
 
 
318 aa  351  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2287  pantothenate kinase  54.29 
 
 
323 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1137  pantothenate kinase  53.42 
 
 
310 aa  345  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.622081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  55.7 
 
 
318 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  56.17 
 
 
313 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0511  pantothenate kinase  53.65 
 
 
328 aa  344  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0599894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  54.1 
 
 
328 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7527  pantothenate kinase  55.31 
 
 
336 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2485  pantothenate kinase  54.19 
 
 
337 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  54.4 
 
 
318 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2777  pantothenate kinase  54.19 
 
 
337 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.518302  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  53.31 
 
 
318 aa  341  7e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  55.05 
 
 
318 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2554  pantothenate kinase  54.19 
 
 
337 aa  341  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  53.7 
 
 
312 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  53.7 
 
 
312 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  53.7 
 
 
312 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  51.79 
 
 
343 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  53 
 
 
318 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6788  pantothenate kinase  54.98 
 
 
335 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  52.12 
 
 
336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  54.05 
 
 
310 aa  338  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  53.38 
 
 
312 aa  338  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2610  pantothenate kinase  51.94 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.787423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  52.45 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  52.73 
 
 
312 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  51.95 
 
 
314 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3973  pantothenate kinase  54.17 
 
 
331 aa  334  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1012  pantothenate kinase  53.55 
 
 
329 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298454  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  52.09 
 
 
312 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  51.44 
 
 
316 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  51.11 
 
 
318 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0241  pantothenate kinase  52.87 
 
 
330 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4300  pantothenate kinase  53.53 
 
 
331 aa  331  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  51.47 
 
 
345 aa  330  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  53.25 
 
 
329 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  53.25 
 
 
309 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  51.94 
 
 
307 aa  328  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  52.44 
 
 
313 aa  328  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  51.45 
 
 
324 aa  328  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  50.81 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0606  pantothenate kinase  55.07 
 
 
313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.582007  normal  0.380558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0039  pantothenate kinase  53.7 
 
 
330 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3257  pantothenate kinase  52.41 
 
 
331 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  49.35 
 
 
320 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  51.13 
 
 
322 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>