More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4201 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4201  glutamate racemase  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000637876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4508  glutamate racemase  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000739162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03852  glutamate racemase  99.3 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000349509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4019  glutamate racemase  99.3 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000548786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03801  hypothetical protein  99.3 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000631879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5431  glutamate racemase  99.24 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000134929  normal  0.011427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4453  glutamate racemase  98.85 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4049  glutamate racemase  98.85 
 
 		 262 aa  524  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000985082  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4414  glutamate racemase  98.85 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000386576  hitchhiker  0.00203904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4019  glutamate racemase  90.46 
 
 		 283 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000394018  decreased coverage  0.00413197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4342  glutamate racemase  90.77 
 
 		 260 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000513683  normal  0.657896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4537  glutamate racemase  90.38 
 
 		 260 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00762513  hitchhiker  0.0000000000462365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4373  glutamate racemase  90 
 
 		 260 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4463  glutamate racemase  90 
 
 		 260 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000170429  hitchhiker  0.00000000000595997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4460  glutamate racemase  90 
 
 		 260 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00398465  hitchhiker  0.000459053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4769  glutamate racemase  74.22 
 
 		 287 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000510238  normal  0.0239463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4072  glutamate racemase  71.43 
 
 		 287 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000383263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0199  glutamate racemase  71.73 
 
 		 285 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000337886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0143  glutamate racemase  71.78 
 
 		 287 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000547214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  70.32 
 
 		 290 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0193  glutamate racemase  71.73 
 
 		 285 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3782  glutamate racemase  67.13 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000154676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0124  glutamate racemase  72.92 
 
 		 240 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000284892  normal  0.0743553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1453  glutamate racemase  49.22 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.010969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002158  glutamate racemase  51.16 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000004702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  47.94 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  49.44 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  47.52 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  48.13 
 
 		 273 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0629  glutamate racemase  44.62 
 
 		 268 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0165  glutamate racemase  51.8 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000122262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2339  glutamate racemase  55.11 
 
 		 265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0194  glutamate racemase  52.34 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000010481  normal  0.0134241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4709  glutamate racemase  46.15 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000583223  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3509  glutamate racemase  46.27 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00151792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2884  glutamate racemase  46.18 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00254237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00256  glutamate racemase  53.88 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0153  glutamate racemase  41.51 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.000846216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  52.25 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000024601  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  52.25 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4177  glutamate racemase  52.25 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000486061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4075  glutamate racemase  51.8 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000696712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4337  glutamate racemase  43.87 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000357145  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0126  glutamate racemase  47.81 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000153552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0232  glutamate racemase  51.61 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000508837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0139  glutamate racemase  50 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000684264  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0781  glutamate racemase  46.12 
 
 		 291 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.264959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3824  glutamate racemase  48.46 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0482316  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1207  glutamate racemase  45.65 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1613  glutamate racemase  45.33 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.572761  normal  0.655413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1338  glutamate racemase  43.51 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1326  glutamate racemase  42.86 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2251  glutamate racemase  47.11 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0194593  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1799  glutamate racemase  40.54 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.627391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0357  glutamate racemase  43.53 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.264447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5384  glutamate racemase  41.47 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2226  glutamate racemase  48.02 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0827  glutamate racemase  42.47 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0389659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1780  glutamate racemase  39.6 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3541  glutamate racemase  46.09 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3412  glutamate racemase  46.4 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3217  glutamate racemase  44.21 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1996  glutamate racemase  40.98 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3847  glutamate racemase  41.38 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.671121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1195  glutamate racemase  39.27 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1157  glutamate racemase  39.27 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.553374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1768  glutamate racemase  45.7 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1916  glutamate racemase  39.83 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1269  glutamate racemase  38.31 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0396  glutamate racemase  41.52 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.971705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  38.74 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3000  glutamate racemase  38.55 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3694  glutamate racemase  43.24 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2160  glutamate racemase  38.15 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0454609  normal  0.382904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1516  glutamate racemase  40.99 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1949  glutamate racemase  40.44 
 
 		 266 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.513252  normal  0.377399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  39.37 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0055  glutamate racemase  38.99 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0124044  normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  38.27 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  39.61 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  39.84 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  42.8 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  39.36 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1606  glutamate racemase  44.09 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1645  glutamate racemase  43.05 
 
 		 265 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  42.34 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  38.25 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  36.29 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1317  glutamate racemase  43.58 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  41.29 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  38.25 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  38.14 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  42.52 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  38.64 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  35.04 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  39.91 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  38.7 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  36.29 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  33.46 
 
 		 259 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  38.57 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>