46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4105 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  73.22 
 
 
295 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  67.01 
 
 
292 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  67.01 
 
 
292 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  66.67 
 
 
292 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  53.95 
 
 
294 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  49.47 
 
 
289 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.61 
 
 
336 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  28.38 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.04 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.25 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  28.21 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  27.85 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.16 
 
 
334 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  25.66 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  26.48 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.93 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  26.5 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  26.1 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.43 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.37 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.38 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.53 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.53 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.09 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.35 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.63 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.63 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.89 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.29 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.56 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.51 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  22.33 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0886  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.87 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.56 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>