More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3305 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02984  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0581  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4430  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.119659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3240  threonine dehydratase  100 
 
 
329 aa  669    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3602  threonine dehydratase  95.14 
 
 
329 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3435  threonine dehydratase  95.14 
 
 
329 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3539  threonine dehydratase  95.14 
 
 
329 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00163646  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3506  threonine dehydratase  95.14 
 
 
329 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3432  threonine dehydratase  95.14 
 
 
329 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  89.67 
 
 
329 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  59.5 
 
 
333 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  59.5 
 
 
333 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  59.19 
 
 
333 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  59.5 
 
 
333 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  59.19 
 
 
333 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  58.88 
 
 
333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  59.19 
 
 
333 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  54.29 
 
 
346 aa  332  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  54.29 
 
 
346 aa  332  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  58.88 
 
 
333 aa  331  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  58.57 
 
 
333 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  48.58 
 
 
403 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  47.62 
 
 
405 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  46.03 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.13 
 
 
403 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  45.71 
 
 
403 aa  276  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  43.77 
 
 
402 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  43.77 
 
 
402 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  43.97 
 
 
403 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  49.52 
 
 
401 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  49.52 
 
 
401 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  47.45 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  44.03 
 
 
404 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.32 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  42.09 
 
 
403 aa  269  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  48.56 
 
 
402 aa  268  8e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43 
 
 
403 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  47.47 
 
 
358 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  46.77 
 
 
402 aa  264  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  45.66 
 
 
401 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.73 
 
 
402 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.22 
 
 
415 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  48.06 
 
 
402 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.44 
 
 
403 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  44.44 
 
 
401 aa  263  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.44 
 
 
403 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  47.6 
 
 
402 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  44.27 
 
 
402 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  42.45 
 
 
403 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.18 
 
 
402 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  47.28 
 
 
403 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  44.76 
 
 
403 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44.86 
 
 
412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  48.38 
 
 
402 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  44.69 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.08 
 
 
403 aa  252  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  47.08 
 
 
402 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  46.13 
 
 
406 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  41.59 
 
 
403 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  41.77 
 
 
408 aa  250  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  39.94 
 
 
400 aa  249  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  43.17 
 
 
403 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  45.57 
 
 
443 aa  249  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.86 
 
 
320 aa  248  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  50.84 
 
 
404 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  48.59 
 
 
402 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  43.91 
 
 
403 aa  246  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  48.38 
 
 
402 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  45.85 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  40.44 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  44.16 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  42.39 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  47.15 
 
 
405 aa  238  8e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  45.08 
 
 
413 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.45 
 
 
332 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  42.19 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.26 
 
 
400 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  42.56 
 
 
537 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.42 
 
 
501 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.99 
 
 
320 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.53 
 
 
321 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  46.69 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  45.45 
 
 
411 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  41.03 
 
 
506 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  41.03 
 
 
506 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  46.5 
 
 
410 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.42 
 
 
399 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  45.78 
 
 
404 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  38.46 
 
 
511 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  43.77 
 
 
416 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.76 
 
 
401 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  44.74 
 
 
403 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  39.26 
 
 
507 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  39.1 
 
 
504 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  39.1 
 
 
504 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>