45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3130 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  98.98 
 
 		 392 aa  789    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  100 
 
 		 392 aa  798    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  94.39 
 
 		 392 aa  758    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  98.21 
 
 		 392 aa  785    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  98.21 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02779  hypothetical protein  94.44 
 
 		 90 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000163075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  26.42 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  22.22 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  25 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  24.44 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  23.02 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  23.62 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  25.41 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  22.49 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  25.41 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  24.1 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  25.44 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  24.04 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  24.1 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  25.41 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  24.1 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  24.63 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  23.69 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  24.36 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  22.99 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  22.38 
 
 		 425 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  23.84 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  22.22 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  23.56 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  24.65 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  24.86 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  23.98 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  23.54 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  27.69 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  22.04 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  22.65 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  25.36 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  25 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  22.64 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  23.67 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  24.22 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  22.83 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  22.28 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  29.13 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  20.61 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>