More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2979 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  94.94 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  94.94 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  94.94 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  94.94 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  94.94 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  82.05 
 
 		 238 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  82.91 
 
 		 238 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  82.48 
 
 		 238 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  81.2 
 
 		 238 aa  361  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  62.23 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  60.43 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  61.86 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  58.55 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  63.91 
 
 		 241 aa  271  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  57.14 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  57.87 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  55.79 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  58.19 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  55.74 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  60.34 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  55.46 
 
 		 246 aa  261  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  61.47 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  59.4 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  55.13 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  59.91 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  55.27 
 
 		 239 aa  254  6e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  54.04 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  58.7 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  55.93 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  58.97 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  57.45 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  52.81 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  58.75 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  57.69 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  52.81 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  52.32 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  57.46 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  50.64 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  57.89 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  57.46 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  53.19 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  56.58 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  57.8 
 
 		 258 aa  244  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  56.58 
 
 		 265 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  56.84 
 
 		 245 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  56.58 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  51.93 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  51.93 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  56.71 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  52.46 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  51.05 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  58.61 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  51.49 
 
 		 518 aa  242  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  55.51 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  53.07 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  58.8 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  57.2 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  52.17 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  57.14 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  51.06 
 
 		 522 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  56.12 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  60.79 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  51.5 
 
 		 274 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 528 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  52.42 
 
 		 251 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  53.39 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  61.23 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  52.42 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  54.66 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  50.44 
 
 		 577 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  53.42 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  51.29 
 
 		 530 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  55.23 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  58.47 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  52.32 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  50.22 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  50 
 
 		 261 aa  234  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  49.12 
 
 		 529 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  55.93 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  51.33 
 
 		 527 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  49.36 
 
 		 522 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  53.95 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  52.59 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  47.81 
 
 		 529 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>