96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2894 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  99.02 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  99.34 
 
 		 305 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  92.46 
 
 		 305 aa  580  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  92.46 
 
 		 305 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  86.71 
 
 		 305 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  85.81 
 
 		 306 aa  533  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  85.15 
 
 		 306 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  85.15 
 
 		 306 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  84.82 
 
 		 307 aa  527  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  84.49 
 
 		 306 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  84.49 
 
 		 307 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  84.82 
 
 		 307 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  77.7 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  75.99 
 
 		 307 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  74.75 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.41 
 
 		 304 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  75.66 
 
 		 309 aa  461  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  74.18 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.9 
 
 		 306 aa  437  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.89 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.12 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  65.89 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  68.73 
 
 		 307 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.01 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.54 
 
 		 303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  62.5 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.32 
 
 		 307 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.93 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.58 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.84 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.58 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  64.69 
 
 		 319 aa  374  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  63.85 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  71.37 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  42.81 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.18 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  39.08 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  39.79 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  38.1 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  39.77 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  39.07 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.91 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.21 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  40.46 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.88 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.79 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  37.74 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  39.78 
 
 		 342 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  35.69 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  39.06 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  38.46 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  34.57 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  35.36 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  35.41 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  36.59 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  34.6 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  35.21 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.09 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  35.07 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  36.71 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  35.27 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  37.99 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  36.3 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  36.76 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.85 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.1 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.66 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  73.49 
 
 		 130 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  26.44 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  21.97 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.19 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  22.83 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  23.79 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  22.71 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  22.71 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.61 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.29 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  26.96 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.7 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.97 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.71 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.29 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.26 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  30.16 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  32.8 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  23.28 
 
 		 545 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  30.3 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  23.32 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  23.32 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.32 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.47 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>