48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2609 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1192  NlpBDapX family lipoprotein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02331  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3699  lipoprotein  99.42 
 
 
344 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2854  lipoprotein  92.44 
 
 
344 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2633  lipoprotein  92.15 
 
 
344 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2722  lipoprotein  92.15 
 
 
344 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12688  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2747  lipoprotein  92.15 
 
 
344 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2681  lipoprotein  92.15 
 
 
344 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2849  lipoprotein  98.55 
 
 
344 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2624  lipoprotein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1199  lipoprotein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02369  lipoprotein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2759  lipoprotein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2609  lipoprotein  100 
 
 
344 aa  698    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2973  lipoprotein  86.05 
 
 
344 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3508  lipoprotein  65.42 
 
 
350 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1140  lipoprotein  64.35 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3178  lipoprotein  64.06 
 
 
345 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0463443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1073  lipoprotein  60.29 
 
 
346 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1248  lipoprotein  62.61 
 
 
352 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2983  lipoprotein  58.26 
 
 
346 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3133  lipoprotein  62.9 
 
 
352 aa  411  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1363  lipoprotein  62.61 
 
 
352 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.206221  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2378  lipoprotein  33.83 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03186  lipoprotein  29.39 
 
 
339 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002794  NlpB lipoprotein component of the protein assembly complex  29.7 
 
 
339 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1737  lipoprotein  29.18 
 
 
339 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1907  lipoprotein-34 NlpB  28.78 
 
 
354 aa  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00617793  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1865  NlpB/DapX family lipoprotein  25.99 
 
 
365 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000807402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2666  NlpB/DapX family lipoprotein  25.15 
 
 
365 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1703  NlpB/DapX family lipoprotein  24.54 
 
 
365 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000363681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02135  lipoprotein-34 NlpB  26.72 
 
 
367 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00349153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1657  NlpB/DapX family lipoprotein  24.23 
 
 
365 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297866  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2339  NlpB/DapX family lipoprotein  24.23 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014226  hitchhiker  0.00000293311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2411  NlpB/DapX family lipoprotein  24.72 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00389139  hitchhiker  0.00606094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1880  lipoprotein-34 NlpB  23.81 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2589  NlpB/DapX family lipoprotein  24.85 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000786749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2551  NlpB/DapX family lipoprotein  24.85 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000648805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1793  NlpBDapX family lipoprotein  24.85 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000036858  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2429  NlpB/DapX family lipoprotein  26.09 
 
 
373 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000329618  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1981  NlpB/DapX family lipoprotein  23.99 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2477  NlpBDapX lipoprotein  23.05 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.893949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1736  NlpBDapX lipoprotein  24.73 
 
 
372 aa  89.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000422629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1849  NlpB/DapX family lipoprotein  26.43 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00809428  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2178  NlpB/DapX family lipoprotein  25.98 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000219579  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1861  NlpB/DapX family lipoprotein  21.36 
 
 
374 aa  56.2  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127123  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1099  uncharacterized lipoprotein  23.79 
 
 
367 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.47194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3182  putative lipoprotein  19.9 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0809995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>