More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2559 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1256  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285694 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2795  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1238  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.848072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2709  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2559  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02284  hypothetical protein  99.66 
 
 
291 aa  582  1e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2578  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.66 
 
 
291 aa  583  1e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3653  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.66 
 
 
291 aa  582  1e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2678  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  97.59 
 
 
291 aa  571  1e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2587  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  97.59 
 
 
291 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2636  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  97.59 
 
 
291 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.399636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2702  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  97.25 
 
 
291 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2808  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  97.25 
 
 
291 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2949  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  93.47 
 
 
291 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1301  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  78.01 
 
 
291 aa  465  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1410  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  78.01 
 
 
291 aa  465  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  78.01 
 
 
291 aa  465  1e-130  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.774717  hitchhiker  0.00253769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3455  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  79.04 
 
 
291 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  71.78 
 
 
288 aa  415  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1004  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  70.73 
 
 
288 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0078  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  70.14 
 
 
280 aa  403  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.94391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1371  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.01 
 
 
285 aa  320  2e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0650  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.61 
 
 
296 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357355  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3191  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.29 
 
 
289 aa  307  2e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3094  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.29 
 
 
289 aa  307  2e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3014  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.29 
 
 
289 aa  305  4e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0486489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1182  sulfate ABC transporter, permease protein  58.3 
 
 
295 aa  305  4e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.27298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.93 
 
 
288 aa  302  4e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0995  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.93 
 
 
288 aa  302  5e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.91629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02323  sulfate/thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
149 aa  302  5e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2959  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.58 
 
 
297 aa  301  7e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3294  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.07 
 
 
288 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.374167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3601  sulfate ABC transporter, permease protein  60.29 
 
 
289 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1800  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.48 
 
 
275 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1003  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.81 
 
 
289 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4316  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.51 
 
 
275 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.356778 
 
 
-
 
NC_004310  BR1328  sulfate ABC transporter, permease protein  58.16 
 
 
276 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00185073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.04 
 
 
293 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2074  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.49 
 
 
277 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  6.41396e-23 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0125  ABC type transporter  52.77 
 
 
304 aa  295  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  3.64812e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1097  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.34 
 
 
288 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1288  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  57.74 
 
 
276 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.749605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1634  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.95 
 
 
315 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4741  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.52 
 
 
316 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00402264  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.38 
 
 
291 aa  285  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1123  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  58.08 
 
 
314 aa  284  1e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1580  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.08 
 
 
314 aa  284  1e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43573  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0067  sulfate ABC transporter, permease protein  58.54 
 
 
287 aa  284  1e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1603  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.08 
 
 
314 aa  284  1e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1545  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  50.93 
 
 
302 aa  283  2e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0583  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.64 
 
 
300 aa  283  2e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.501211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0594  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.64 
 
 
300 aa  283  3e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1499  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.08 
 
 
315 aa  282  4e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0610  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  48.3 
 
 
298 aa  282  5e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3892  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  49.44 
 
 
294 aa  282  5e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1222  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.37 
 
 
326 aa  282  6e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.917674  normal  0.204361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.13 
 
 
285 aa  281  6e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1198  sulfate ABC transporter, permease protein  54.13 
 
 
285 aa  282  6e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1285  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.37 
 
 
328 aa  281  6e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1127  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  54.13 
 
 
285 aa  281  7e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1969  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  52.14 
 
 
307 aa  281  7e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1775  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.14 
 
 
350 aa  281  8e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0521176  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2468  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysW  57.14 
 
 
346 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579343  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3558  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  48.93 
 
 
292 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0558  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.26 
 
 
300 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4588  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.96 
 
 
335 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1519  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.08 
 
 
315 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172218  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3691  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  52.63 
 
 
287 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5391  sulfate ABC transporter permease protein CysW  54.88 
 
 
289 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  47.93 
 
 
293 aa  279  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2378  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  53.09 
 
 
339 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1376  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  51.99 
 
 
287 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.535753  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5169  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.53 
 
 
290 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2478  sulfate ABC transporter, permease protein  57.64 
 
 
340 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1377  sulfate ABC transporter permease protein CysW  52.04 
 
 
305 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5229  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.16 
 
 
290 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.587413  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.16 
 
 
290 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.500562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1849  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.77 
 
 
348 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3184  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  48.26 
 
 
289 aa  273  2e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0224874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2762  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.99 
 
 
285 aa  274  2e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.665279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  51.88 
 
 
274 aa  274  2e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  51.88 
 
 
274 aa  274  2e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1863  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.77 
 
 
344 aa  273  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2016  sulfate transport system permease protein  56.77 
 
 
344 aa  273  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1856  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.73 
 
 
276 aa  273  2e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0302339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4008  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  50.35 
 
 
298 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3627  sulfate ABC transporter inner membrane subunit  50.97 
 
 
279 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6975  sulfate/thiosulfate permease W  53.23 
 
 
301 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1627  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.22 
 
 
334 aa  272  4e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.486831 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1696  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.33 
 
 
352 aa  272  5e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0434814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0808  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.33 
 
 
352 aa  272  5e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1207  sulfate ABC transporter, permease protein  56.33 
 
 
292 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4116  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  51.7 
 
 
286 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.943743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0352  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.33 
 
 
348 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.387041  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1521  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.61 
 
 
303 aa  271  8e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.561471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2547  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  53.53 
 
 
315 aa  271  8e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5076  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  52.79 
 
 
290 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.10666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1396  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  55.82 
 
 
288 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0504  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  52.16 
 
 
293 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1904  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  54.02 
 
 
278 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.47228e-07  hitchhiker  1.52704e-11 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>