More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2384 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  99.49 
 
 
396 aa  823    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  99.49 
 
 
396 aa  823    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  72.91 
 
 
415 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  85.1 
 
 
396 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  77.35 
 
 
400 aa  658    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  99.49 
 
 
396 aa  823    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  94.19 
 
 
396 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  72.91 
 
 
431 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  75.57 
 
 
400 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  99.75 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  99.49 
 
 
396 aa  823    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  100 
 
 
396 aa  825    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  93.94 
 
 
396 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  94.19 
 
 
396 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  93.94 
 
 
396 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  79.19 
 
 
399 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  77.58 
 
 
403 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  72.91 
 
 
415 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  77.33 
 
 
403 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  93.94 
 
 
396 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  62.66 
 
 
423 aa  527  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  59.34 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  57.83 
 
 
424 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  48.74 
 
 
400 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  36.25 
 
 
499 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.15 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.22 
 
 
415 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.53 
 
 
409 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.87 
 
 
416 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  33.92 
 
 
448 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.55 
 
 
453 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  33 
 
 
478 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.51 
 
 
409 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.61 
 
 
459 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.12 
 
 
461 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  28.08 
 
 
455 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.33 
 
 
455 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
455 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  27.25 
 
 
454 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 
962 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.03 
 
 
978 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  28.53 
 
 
1032 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 
976 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.58 
 
 
1015 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.59 
 
 
429 aa  157  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 
1055 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.37 
 
 
1035 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.67 
 
 
447 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  28.77 
 
 
973 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 
1020 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  27.95 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  30.2 
 
 
952 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  28.13 
 
 
1024 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.73 
 
 
1023 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  27.5 
 
 
1070 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  30.23 
 
 
442 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  26.43 
 
 
730 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.53 
 
 
984 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  26.63 
 
 
996 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  28.61 
 
 
445 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  27.54 
 
 
717 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  30.23 
 
 
711 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.03 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.27 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.34 
 
 
445 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  27.12 
 
 
967 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2628  hypothetical protein  29.5 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0048  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  26.33 
 
 
468 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.923386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2490  hypothetical protein  29.5 
 
 
445 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  29.33 
 
 
1050 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 
1014 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  27.25 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.25 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.25 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  28.86 
 
 
1024 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0269  hypothetical protein  28.88 
 
 
445 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1646  hypothetical protein  28.88 
 
 
445 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0301  hypothetical protein  28.88 
 
 
445 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  28.93 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.63 
 
 
1025 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1449  hypothetical protein  28.57 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.65 
 
 
947 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.68 
 
 
708 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.51 
 
 
445 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0922  putative ferredoxin  28.88 
 
 
445 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  26.74 
 
 
445 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.33 
 
 
1007 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.27 
 
 
445 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  26.82 
 
 
711 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.32 
 
 
1005 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.25 
 
 
445 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 
1050 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  27.06 
 
 
711 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  25.75 
 
 
1023 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  27.65 
 
 
712 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  26.02 
 
 
399 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.630234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>