33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1749 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  98.69 
 
 		 534 aa  1091    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  98.69 
 
 		 534 aa  1091    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  98.69 
 
 		 534 aa  1088    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1106    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1106    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  70.22 
 
 		 536 aa  791    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  98.69 
 
 		 534 aa  1091    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  52.87 
 
 		 534 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  52.87 
 
 		 534 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  28.15 
 
 		 572 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  27.04 
 
 		 578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  29.83 
 
 		 582 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1868  FAD dependent oxidoreductase  98.82 
 
 		 85 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.189334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  25.99 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  25.76 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  24.03 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  22.13 
 
 		 494 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  24.02 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  23.43 
 
 		 490 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  25.59 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  24.83 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.86 
 
 		 443 aa  47.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.57 
 
 		 1072 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  22.05 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  22.33 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  26.19 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  22.35 
 
 		 473 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  23.01 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  30.77 
 
 		 624 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  23.6 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.39 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.39 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>