More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1736 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  89.61 
 
 
388 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  99.23 
 
 
389 aa  744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  99.49 
 
 
389 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  752    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  68.27 
 
 
388 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  67.37 
 
 
395 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  67.11 
 
 
395 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  72 
 
 
401 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  68.63 
 
 
400 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  71.73 
 
 
401 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  73.3 
 
 
400 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  67.38 
 
 
393 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  72.48 
 
 
400 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  72 
 
 
401 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  72 
 
 
401 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  74.84 
 
 
408 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  71.73 
 
 
401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  74.53 
 
 
401 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  63.93 
 
 
404 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  62.5 
 
 
386 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  61.13 
 
 
391 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  58.95 
 
 
395 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  61 
 
 
391 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  61 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  51.86 
 
 
390 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  60.67 
 
 
391 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  58.2 
 
 
390 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  55.8 
 
 
391 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  56.82 
 
 
389 aa  359  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  50.85 
 
 
392 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  49.87 
 
 
388 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  50.56 
 
 
388 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  47.55 
 
 
391 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  49.06 
 
 
391 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  48.79 
 
 
391 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
390 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
390 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
390 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
390 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 
391 aa  322  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  50.85 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  47.41 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  50.85 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  50.56 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  47.99 
 
 
391 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  51.34 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.45 
 
 
416 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.45 
 
 
391 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  45.72 
 
 
408 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  50.29 
 
 
405 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
388 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  48.7 
 
 
385 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  46.61 
 
 
388 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 
391 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.96 
 
 
387 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  48.44 
 
 
388 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  48.16 
 
 
388 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  45.41 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  45.41 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  45.41 
 
 
389 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  46.19 
 
 
389 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  46.4 
 
 
388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  46.2 
 
 
389 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  49.57 
 
 
397 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
388 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  44.56 
 
 
391 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  47.74 
 
 
389 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  47.74 
 
 
389 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
392 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  47.74 
 
 
389 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.89 
 
 
389 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  44.69 
 
 
412 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
389 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  50.14 
 
 
393 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  46.89 
 
 
389 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  45.45 
 
 
406 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  47.23 
 
 
384 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  44.68 
 
 
406 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  44.19 
 
 
378 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  44.32 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  48.12 
 
 
388 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  45.86 
 
 
386 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  45.86 
 
 
386 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  45.86 
 
 
386 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  46.48 
 
 
407 aa  272  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  47.54 
 
 
388 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  48.49 
 
 
392 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
393 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 
404 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>