17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1645 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1645  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000957166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1182  hypothetical protein  93.75 
 
 
116 aa  223  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000101363  hitchhiker  0.0000000000286318 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01344  hypothetical protein  92.86 
 
 
114 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.2908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01335  conserved hypothetical protein  92.86 
 
 
114 aa  218  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.286861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0945  hypothetical protein  89.29 
 
 
114 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1449  hypothetical protein  89.29 
 
 
104 aa  157  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1528  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3877  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2255  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000312012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1269  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1773  hypothetical protein  62.28 
 
 
114 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0772608  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2786  hypothetical protein  61.4 
 
 
114 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.531617  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2082  hypothetical protein  83.78 
 
 
103 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2089  protein of unknown function DUF1327  83.78 
 
 
103 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000665043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2185  hypothetical protein  60.78 
 
 
135 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1857  hypothetical protein  57.89 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.799014  hitchhiker  0.00000064633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3209  hypothetical protein  57.89 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0295899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>