23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1357 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2400  protein of unknown function DUF440  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01232  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0363046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1734  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0138736  normal  0.192836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1417  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.286101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1892  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.739591  normal  0.0252287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1357  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000132113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1396  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2380  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207058  hitchhiker  0.00000100357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01222  dsDNA-mimic protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0362089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2296  dsDNA-mimic protein  88.99 
 
 		 109 aa  203  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.766684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2064  dsDNA-mimic protein  90.65 
 
 		 117 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2157  dsDNA-mimic protein  90.65 
 
 		 107 aa  201  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0107208  normal  0.0344065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1954  dsDNA-mimic protein  90.65 
 
 		 107 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.257517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2190  dsDNA-mimic protein  88.79 
 
 		 107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00748564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2690  dsDNA-mimic protein  89.72 
 
 		 107 aa  197  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164127  hitchhiker  0.00123555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1990  dsDNA-mimic protein  87.85 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1949  dsDNA-mimic protein  86.92 
 
 		 107 aa  193  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2291  dsDNA-mimic protein  86.92 
 
 		 107 aa  193  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.015292  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02752  dsDNA-mimic protein  50 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1846  dsDNA-mimic protein  53 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003094  hypothetical protein  49.04 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000383318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0828  dsDNA-mimic protein  50 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000360245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0995  dsDNA-mimic protein  42.72 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.952425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>