62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1160 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  100 
 
 
160 aa  297  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  100 
 
 
160 aa  297  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  99.34 
 
 
160 aa  295  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  82.78 
 
 
151 aa  255  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  82.12 
 
 
151 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  82.12 
 
 
151 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  82.12 
 
 
151 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  81.46 
 
 
151 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  79.47 
 
 
151 aa  248  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  40.2 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  39.62 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  36.15 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  36.15 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  38.71 
 
 
245 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  35.38 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  35.64 
 
 
178 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  32.12 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  33.33 
 
 
552 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  37.04 
 
 
564 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  36.17 
 
 
578 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0006  hypothetical protein  35.16 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  35.24 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  43.28 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  29.6 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  31.87 
 
 
503 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  34.02 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  33.68 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  38.03 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  32.04 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  32.03 
 
 
453 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  37.25 
 
 
481 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  32.99 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  32.99 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  34.02 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  32.99 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  38.57 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  32.77 
 
 
483 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.62 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  30.48 
 
 
496 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  28.97 
 
 
498 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  29.82 
 
 
517 aa  43.9  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  30.39 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  31.19 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  41 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  31 
 
 
627 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  40.26 
 
 
498 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  30 
 
 
481 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  28.57 
 
 
500 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3750  Curlin associated repeat protein  32.38 
 
 
585 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  31.87 
 
 
496 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  34.57 
 
 
496 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  34.57 
 
 
496 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  34.57 
 
 
496 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  31.31 
 
 
434 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  34.07 
 
 
281 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>