More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0976 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  99.38 
 
 
322 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  99.38 
 
 
322 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  99.38 
 
 
322 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  98.14 
 
 
322 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 
322 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  99.38 
 
 
322 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  99.38 
 
 
322 aa  666    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  99.38 
 
 
322 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  99.38 
 
 
322 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.44 
 
 
323 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.44 
 
 
323 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  89.13 
 
 
323 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  88.82 
 
 
323 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  88.82 
 
 
323 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  85.4 
 
 
322 aa  597  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.05 
 
 
341 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.57 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.59 
 
 
334 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  60.3 
 
 
335 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.7 
 
 
335 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 
340 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 
340 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 
352 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.71 
 
 
380 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.4 
 
 
376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.41 
 
 
380 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.96 
 
 
374 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.84 
 
 
361 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 
325 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.54 
 
 
367 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.43 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.6 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.73 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.54 
 
 
388 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  33.82 
 
 
356 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  32.06 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.52 
 
 
363 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.52 
 
 
356 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.38 
 
 
365 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  33.55 
 
 
351 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.26 
 
 
382 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.01 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.99 
 
 
382 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.38 
 
 
407 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.99 
 
 
382 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.06 
 
 
364 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.79 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  31.79 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.79 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.79 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  29.97 
 
 
362 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.06 
 
 
381 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.06 
 
 
380 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.06 
 
 
380 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.09 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.33 
 
 
396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  32.94 
 
 
379 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  31.88 
 
 
379 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.24 
 
 
366 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  29.14 
 
 
368 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.24 
 
 
366 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.4 
 
 
375 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.81 
 
 
383 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 
381 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.19 
 
 
367 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.47 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  28.77 
 
 
372 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  29.05 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.73 
 
 
381 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.94 
 
 
375 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.4 
 
 
385 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.25 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.35 
 
 
627 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.38 
 
 
414 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.35 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.25 
 
 
366 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.35 
 
 
366 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.14 
 
 
418 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  28.19 
 
 
366 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.35 
 
 
390 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.06 
 
 
368 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.71 
 
 
363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.14 
 
 
375 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  32.64 
 
 
381 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.32 
 
 
670 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  27.62 
 
 
597 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.08 
 
 
625 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.3 
 
 
585 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.73 
 
 
702 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.7 
 
 
358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.45 
 
 
669 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.31 
 
 
688 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  33.78 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.7 
 
 
397 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  31.99 
 
 
662 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  26.44 
 
 
355 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  28.16 
 
 
394 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>