275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0757 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  99.59 
 
 		 493 aa  996    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 493 aa  998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  99.59 
 
 		 493 aa  995    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  99.19 
 
 		 493 aa  994    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  99.59 
 
 		 493 aa  996    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 493 aa  998    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  88.24 
 
 		 493 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  99.39 
 
 		 493 aa  994    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  88.24 
 
 		 493 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  99.59 
 
 		 493 aa  996    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  88.03 
 
 		 493 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  88.03 
 
 		 493 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  88.24 
 
 		 493 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  99.39 
 
 		 493 aa  994    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  59.14 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  58.44 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  58.44 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  58.44 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  58.44 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  58.44 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  57.59 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  57.59 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  57.81 
 
 		 485 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  57.38 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  32.13 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.61 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  31.02 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  29.21 
 
 		 534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  30.48 
 
 		 461 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  29.7 
 
 		 506 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  30.27 
 
 		 461 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  29.48 
 
 		 506 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.22 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  29.41 
 
 		 506 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  28.71 
 
 		 539 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  30.51 
 
 		 544 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  27.22 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  27.22 
 
 		 539 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  27.22 
 
 		 539 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  28.99 
 
 		 492 aa  203  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  30.86 
 
 		 544 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  28.99 
 
 		 492 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  30.92 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  31.73 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  31.12 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  28.81 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  28.81 
 
 		 506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  30.18 
 
 		 507 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  28.92 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 506 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.45 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  31.19 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  29.6 
 
 		 477 aa  197  5.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  29.53 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  29.53 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  31.75 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  31.75 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  31.76 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  31.55 
 
 		 449 aa  191  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  27.85 
 
 		 462 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  28.05 
 
 		 523 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  31.2 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  28.34 
 
 		 516 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  29.48 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  28.98 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  28.23 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  28.05 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  28.23 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  30.75 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.04 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  28.42 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  29.17 
 
 		 462 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  31.84 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  28.93 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  28.93 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  28.93 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  28.93 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  28.93 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  29.06 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  28.54 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  28.54 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  29.06 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  29.06 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  29.06 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  27.74 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  28.93 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  32.94 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  30.09 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  28.66 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>