More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0569 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  99.56 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  100 
 
 		 225 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  99.56 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  98.67 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  99.11 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  98.67 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  99.11 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  98.67 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  97.33 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  75.56 
 
 		 225 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  75.56 
 
 		 225 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  75.11 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  75.11 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  74.67 
 
 		 225 aa  357  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  62.22 
 
 		 225 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.76 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.76 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  41.95 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  41.95 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  35.61 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 255 aa  128  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  39.46 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3834  ABC transporter related  34.63 
 
 		 359 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.6 
 
 		 365 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  36.67 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  34.15 
 
 		 365 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  37.61 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  34.17 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  37.06 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  35.12 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  33.33 
 
 		 353 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0083  ABC transporter related  33.49 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 381 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 		 364 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  30.24 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  39.8 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  33.33 
 
 		 353 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 		 330 aa  121  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  33.48 
 
 		 366 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  35.91 
 
 		 696 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  36.36 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 375 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 375 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.05 
 
 		 332 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 374 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  35.55 
 
 		 363 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  34.76 
 
 		 329 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  34.6 
 
 		 329 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 355 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  34.76 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  33.33 
 
 		 362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  34.22 
 
 		 269 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  34.76 
 
 		 326 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  34.68 
 
 		 350 aa  118  7e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  35.24 
 
 		 329 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 		 359 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  34.88 
 
 		 374 aa  118  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  33.49 
 
 		 605 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  36.27 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  35.27 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  35.55 
 
 		 363 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3244  ABC transporter related  39.69 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  33.48 
 
 		 353 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  32.99 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  35.45 
 
 		 362 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  34.6 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  36.31 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.55 
 
 		 363 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  34.78 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  32.86 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.81 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  34.26 
 
 		 1360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1074  ABC transporter related  36.68 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  34.43 
 
 		 721 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  39.55 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  33.33 
 
 		 359 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.59 
 
 		 360 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.08 
 
 		 354 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  38.31 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  34.76 
 
 		 372 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  33.5 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 330 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.81 
 
 		 329 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 		 366 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.88 
 
 		 362 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  35.89 
 
 		 358 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 579 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  34.8 
 
 		 343 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>