More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0539 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  798  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  798  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
409 aa  798  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
397 aa  798  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  99.75 
 
 
409 aa  795  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  99.75 
 
 
409 aa  796  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  798  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  83.88 
 
 
397 aa  648  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
397 aa  798  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  100 
 
 
397 aa  798  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  77.61 
 
 
395 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  2.30672e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  75.26 
 
 
395 aa  582  1e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  75.26 
 
 
395 aa  582  1e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.85 
 
 
395 aa  575  1e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  75.54 
 
 
388 aa  571  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  72.11 
 
 
398 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.09 
 
 
396 aa  540  1e-152  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  74.74 
 
 
397 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  69.07 
 
 
385 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  69.33 
 
 
385 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  69.07 
 
 
385 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  69.33 
 
 
385 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  69.07 
 
 
385 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  69.07 
 
 
385 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  69.33 
 
 
385 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  69.33 
 
 
385 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.10651e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.33 
 
 
385 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  70.4 
 
 
385 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  70.4 
 
 
385 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  70.4 
 
 
385 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  70.13 
 
 
385 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  67.2 
 
 
379 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  65.24 
 
 
390 aa  471  1e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.42 
 
 
422 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.78 
 
 
433 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  57.88 
 
 
392 aa  416  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  59.03 
 
 
442 aa  406  1e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  54.45 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  54.45 
 
 
385 aa  406  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  59.3 
 
 
383 aa  407  1e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  57.42 
 
 
382 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  54.19 
 
 
385 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  54.79 
 
 
386 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  60.22 
 
 
400 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.26 
 
 
386 aa  399  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  51.66 
 
 
405 aa  400  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  55.85 
 
 
384 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.31 
 
 
399 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  56.08 
 
 
386 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  54.55 
 
 
384 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  54.52 
 
 
384 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.52 
 
 
384 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  62.08 
 
 
395 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  55.43 
 
 
381 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  54.33 
 
 
385 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  55.08 
 
 
405 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  55.7 
 
 
387 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  54.5 
 
 
420 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  54.5 
 
 
420 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  54.5 
 
 
420 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  54.5 
 
 
420 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  54.5 
 
 
420 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  54.5 
 
 
420 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  55.12 
 
 
394 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  55.2 
 
 
394 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  53.13 
 
 
425 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  54.11 
 
 
394 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  54.22 
 
 
420 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  52.82 
 
 
400 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  54.76 
 
 
398 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.43 
 
 
410 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  53.78 
 
 
420 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  53.51 
 
 
412 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.41 
 
 
403 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  53.68 
 
 
412 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  53.68 
 
 
412 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  56.06 
 
 
418 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  57.48 
 
 
432 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  54.08 
 
 
431 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  53.41 
 
 
424 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  53.41 
 
 
424 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  53.41 
 
 
424 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.87 
 
 
415 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.24 
 
 
411 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  56.76 
 
 
412 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  56.89 
 
 
432 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  52.8 
 
 
423 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  48.53 
 
 
386 aa  357  2e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.35 
 
 
393 aa  356  4e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>