More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0341 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1445    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  61.28 
 
 		 687 aa  892    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  69.85 
 
 		 686 aa  1004    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  70.75 
 
 		 676 aa  1013    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  62.3 
 
 		 678 aa  901    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  72.88 
 
 		 679 aa  1068    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  44.36 
 
 		 676 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  44.28 
 
 		 678 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 		 679 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  43.75 
 
 		 676 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  43.03 
 
 		 684 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  39.79 
 
 		 684 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  39.91 
 
 		 682 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  40.54 
 
 		 681 aa  492  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  39.64 
 
 		 681 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  39.65 
 
 		 682 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  48.03 
 
 		 686 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  38.98 
 
 		 682 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  46.23 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  47 
 
 		 670 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  47.18 
 
 		 703 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  45.69 
 
 		 694 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  47.18 
 
 		 675 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  31.93 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.02 
 
 		 508 aa  247  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  33.26 
 
 		 470 aa  246  9e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  30.96 
 
 		 469 aa  237  6e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  27.67 
 
 		 477 aa  207  7e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  26.88 
 
 		 473 aa  196  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  29.35 
 
 		 485 aa  191  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.43 
 
 		 485 aa  185  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  26.79 
 
 		 186 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  29.24 
 
 		 810 aa  67.8  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  29.01 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  27.38 
 
 		 819 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 815 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  28.4 
 
 		 812 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  28.42 
 
 		 788 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  28.4 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  30.06 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  24.89 
 
 		 774 aa  60.8  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  25.97 
 
 		 802 aa  60.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 		 810 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  24.54 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 		 823 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  29.11 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  28.19 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 		 794 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  28.29 
 
 		 783 aa  58.9  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  26.32 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  26.63 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 802 aa  58.5  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  25.17 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  27.81 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  28.77 
 
 		 856 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.33 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 		 867 aa  57.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  27.98 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  27.91 
 
 		 781 aa  57.4  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 		 812 aa  57  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 		 804 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 774 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 		 806 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  26.42 
 
 		 797 aa  57  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  26.22 
 
 		 812 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 		 812 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.3 
 
 		 793 aa  57  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 		 806 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  27.63 
 
 		 785 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.3 
 
 		 793 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 		 802 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  26.23 
 
 		 794 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  25.54 
 
 		 817 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 675 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  25.27 
 
 		 801 aa  55.8  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  24.9 
 
 		 780 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  29.44 
 
 		 808 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  27.71 
 
 		 805 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  27.63 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  26.97 
 
 		 816 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  25.97 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  25.15 
 
 		 779 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 		 821 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 		 807 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  29.25 
 
 		 819 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 		 805 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>