93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0322 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  29.29 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  25.73 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.22 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  27.54 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  25.87 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  25.87 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  24.88 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.66 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  25.45 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  27.01 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  27.23 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  30.46 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  29.47 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.23 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  26.73 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  24.38 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  25.24 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.21 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  24.38 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  29.41 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  33.33 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  33.33 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  24.1 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  24.42 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  44.62 
 
 		 372 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.88 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 72 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  24.75 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  22.77 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  23.91 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1947  transcriptional regulator protein  29.41 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  23.33 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  44.26 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  24.78 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  36.99 
 
 		 131 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  26.46 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  33.68 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  24.84 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 359 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0223  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  29.91 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  41.18 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  40.98 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 371 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  32.88 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 132 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  24 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 132 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  23.22 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.47 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  33.33 
 
 		 534 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 115 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  37.14 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  40 
 
 		 94 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  35.48 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 117 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 139 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 212 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.27 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 67 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 87 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  32.05 
 
 		 235 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  35.48 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  28.67 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 180 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.48 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>