120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0087 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1170    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  31.8 
 
 
596 aa  300  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.8 
 
 
596 aa  300  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  31.8 
 
 
596 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.86 
 
 
567 aa  177  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.34 
 
 
585 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.99 
 
 
583 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  30.41 
 
 
607 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.17 
 
 
572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  28.35 
 
 
550 aa  156  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.6 
 
 
576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.86 
 
 
554 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  26.28 
 
 
576 aa  147  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.89 
 
 
578 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.31 
 
 
592 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  27.98 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.97 
 
 
554 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.63 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  27.45 
 
 
553 aa  137  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  27.72 
 
 
545 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  28.35 
 
 
556 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.85 
 
 
561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  26.13 
 
 
554 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  26.95 
 
 
575 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  24.79 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  24.79 
 
 
567 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  24.79 
 
 
567 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.7 
 
 
586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.59 
 
 
574 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.63 
 
 
595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.68 
 
 
569 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  26.42 
 
 
442 aa  99  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.94 
 
 
747 aa  94.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
571 aa  94.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.45 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  25.4 
 
 
608 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.41 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
692 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  29.8 
 
 
568 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  28.72 
 
 
568 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.57 
 
 
569 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.2 
 
 
584 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.86 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.81 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  22 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  22.37 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.97 
 
 
545 aa  73.6  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.05 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.38 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.72 
 
 
558 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.09 
 
 
692 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.48 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.48 
 
 
591 aa  67  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.66 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  28.52 
 
 
570 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.47 
 
 
585 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.2 
 
 
557 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  22.03 
 
 
551 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  22.03 
 
 
551 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.78 
 
 
549 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.81 
 
 
591 aa  64.3  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.72 
 
 
587 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.35 
 
 
570 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.87 
 
 
592 aa  62  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  29.1 
 
 
599 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.42 
 
 
568 aa  60.1  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.78 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.78 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.57 
 
 
592 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.14 
 
 
560 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  25.85 
 
 
564 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.85 
 
 
592 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.2 
 
 
560 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.44 
 
 
562 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.39 
 
 
562 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.91 
 
 
562 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  21.72 
 
 
588 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23 
 
 
597 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  22.81 
 
 
539 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  27.9 
 
 
565 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  20.04 
 
 
585 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.34 
 
 
561 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.79 
 
 
573 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.66 
 
 
538 aa  53.5  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.15 
 
 
580 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.65 
 
 
610 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  22.79 
 
 
558 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.27 
 
 
553 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.06 
 
 
559 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.31 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  23.54 
 
 
581 aa  50.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  23.66 
 
 
562 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.12 
 
 
569 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.37 
 
 
563 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.14 
 
 
575 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25.53 
 
 
583 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  32.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.61 
 
 
592 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  28.85 
 
 
310 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  23.12 
 
 
569 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>