11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0020 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0020  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  634    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00212726  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0048  hypothetical protein  97.67 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000955656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0015  hypothetical protein  91.23 
 
 		 308 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.838494  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0011  hypothetical protein  89.94 
 
 		 308 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0041  hypothetical protein  89.94 
 
 		 308 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.432272  normal  0.0746912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4056  hypothetical protein  34.98 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0397  hypothetical protein  35.97 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567946  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4121  hypothetical protein  37.41 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3369  IS21 family transposition helper protein  32.89 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1327  hypothetical protein  31.75 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0473918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>