299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_5062 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.978432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2816  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.78487e-09  hitchhiker  0.000205379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3938  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.66578e-06  normal  0.898154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3937  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000231396  normal  0.899898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3026  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  5.87212e-06  decreased coverage  6.37793e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3133  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.62768e-06  hitchhiker  0.00744411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3132  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.96621e-06  hitchhiker  0.00734421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3131  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  3.83437e-05  hitchhiker  0.00759895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3130  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000278936  hitchhiker  0.00759895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3939  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.23464e-07  normal  0.878654 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2815  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.06258e-09  hitchhiker  0.000196264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.17209e-07  hitchhiker  0.00392974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.29117e-06  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.77266e-06  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000113112  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3940  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.16787e-08  normal  0.873101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2813  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.34926e-07  hitchhiker  0.000405457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2814  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.33907e-09  hitchhiker  0.000209563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2943  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.01513e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2942  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  9.46931e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2941  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.91828e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3024  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  7.63539e-05  hitchhiker  1.22592e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3023  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00222137  hitchhiker  1.30091e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3402  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.12261e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3311  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.02853e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3303  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.00797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0073  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.74469e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0072  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.63707e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0071  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.4957e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3025  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  6.05333e-06  hitchhiker  1.24433e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3007  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0130916  hitchhiker  1.87167e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2940  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.00843e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2975  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  3.54138e-06  decreased coverage  5.21944e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2974  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  3.06621e-06  decreased coverage  5.05699e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2973  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.85048e-05  decreased coverage  5.13865e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2972  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  9.72805e-05  decreased coverage  4.9026e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3010  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000160171  hitchhiker  2.13321e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3009  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00101658  hitchhiker  2.07447e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3008  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  hitchhiker  1.93461e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0070  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.35454e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.968196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0071  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0070  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.81363e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00141973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4689  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.97253e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4690  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.01882e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4691  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.89876e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00046  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00171034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5060  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.63058e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5061  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.41029e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5062  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.87047e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0069  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.38486e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4688  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.05665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  5.95949e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  5.79365e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  5.90323e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00047  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000114656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00048  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.0417e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00049  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.117e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.61403e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.81714e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0068  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.42044e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.02017e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5059  tRNA-Arg  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.27208e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0032  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  9.59667e-12  hitchhiker  1.84359e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0033  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  9.89089e-12  hitchhiker  1.87965e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0034  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.69969e-10  hitchhiker  1.84359e-07 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0202  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg02  tRNA-Arg  97.26 
 
 
80 bp  129  1e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0078  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.77536e-06  decreased coverage  4.48266e-08 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0080  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.92211e-06  decreased coverage  4.40433e-08 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0079  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  121  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.9994e-06  decreased coverage  4.14359e-08 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4607  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  117  4e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0229671  normal  0.529738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0382605  normal  0.525987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52540  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  117  4e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.36889e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.477041  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.35355  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52550  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  117  4e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.30031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364082  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4608  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  117  4e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  117  4e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0387669  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg03  tRNA-Arg  98.36 
 
 
80 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0057  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.04171e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4268  tRNA-Arg  94.29 
 
 
79 bp  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.71712e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4269  tRNA-Arg  94.29 
 
 
79 bp  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.7764e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4270  tRNA-Arg  94.29 
 
 
79 bp  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.97355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0896  tRNA-Arg  94.29 
 
 
79 bp  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  3.79192e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0895  tRNA-Arg  94.29 
 
 
79 bp  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  3.37505e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0056  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.08467e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0055  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.06341e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0078  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0044  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00997597  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0043  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0100237  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0045  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0174897  normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0042  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0180356  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0081  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0080  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>