299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_5019 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_t00010  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.07047e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0738  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.96563e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0734  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  5.72043e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0579  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.27758e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0388  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.2647e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0781  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  7.29773e-05  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0031  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  6.29379e-08  hitchhiker  0.000794999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.30461e-09  hitchhiker  0.000751114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0692  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  5.20696e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0688  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.20772e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1763  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.11546e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1771  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.41128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0078  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.44177e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0074  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.08683e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0793  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00146175  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0798  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00121297  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0759  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.82067e-06  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00014  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.32366e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5019  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.40299e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5015  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.19916e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0061  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.99234e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0065  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0720  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.47537e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4654  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.94372e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0724  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.98131e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0832  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.91902e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0763  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.6187e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4650  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.49948e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0785  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.9431e-06  normal  0.369596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0828  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  8.35761e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1767  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.43929e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna132  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.90983e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna143  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.03927e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna135  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.74984e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna147  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.33162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0048  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.7739e-06  normal  0.0157813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0044  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.82394e-05  normal  0.033686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4259  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0028  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.67131e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4255  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1357e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0061  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet03  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  2e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00892587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0035  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.93929e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.75201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0062  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000650555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.240758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0027  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155792  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0049  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00205425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0329  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.53412e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0332  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.36063e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0066  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0032  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  8.31848e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3154t  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  9.67763e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3567  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0065  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0091  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.62007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3562  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3149t  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  7.67874e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0006  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0073  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.19508e-06  normal  0.0429545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0071  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.2956e-06  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.058148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0048  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  4.40965e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  3.86072e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0102  tRNA-Met  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.10016e-07  normal  0.102262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0074  tRNA-Met  97.62 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135637  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0069  tRNA-Met  97.62 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439816  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0106  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.45591e-10  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0100  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.40677e-09  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0096  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  7.71704e-07  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0052  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.526652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0153  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.29594e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0101  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.09758e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0129  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.30942e-09  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0116  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.26363e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0112  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.85548e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0108  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.25479e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0105  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.02123e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0156  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.53856e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0120  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.49976e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0125  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000214753  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0159  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.01379e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t108  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.18343e-09  hitchhiker  5.2642e-10 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t018  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0033  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.81749e-07  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0038  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000161182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0030  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.78723e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0031  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.67357e-10  normal  0.0254093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0035  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.6454e-07  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t014  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0032  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.7089e-10  normal  0.142093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t013  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.14065e-08  hitchhiker  4.83497e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0036  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.24362e-08  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0037  tRNA-Met  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000667787  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0026  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.83992e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0034  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000193112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>