276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4891 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  98.97 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  97.93 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  97.59 
 
 		 290 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  97.24 
 
 		 290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  95.52 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  97.81 
 
 		 236 aa  364  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  59.79 
 
 		 291 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  59.79 
 
 		 291 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  50.85 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.83 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.48 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.36 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  44.67 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  43.43 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  37.1 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  37.1 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  29.67 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  30.26 
 
 		 635 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.93 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  34.48 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  25.22 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  28.33 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  25.22 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.63 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.39 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  27.39 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  27.38 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  27.38 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 529 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.94 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  25.36 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.95 
 
 		 513 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  27.78 
 
 		 523 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.3 
 
 		 517 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  27.04 
 
 		 438 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 451 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  21.58 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  21.58 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  22.84 
 
 		 433 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  30.95 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.27 
 
 		 440 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  25.95 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  25.14 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  28.34 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  28.72 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  20.53 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  25.89 
 
 		 438 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  25.95 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  23.5 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  24.04 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  26.09 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  25.28 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  26.54 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.57 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  30.89 
 
 		 489 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  23.08 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  23.93 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  26.79 
 
 		 614 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 506 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  32.79 
 
 		 451 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.53 
 
 		 566 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  32.35 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  24.86 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  26.09 
 
 		 501 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  28.43 
 
 		 550 aa  48.9  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  28.8 
 
 		 495 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  24.19 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  28.32 
 
 		 447 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  30.58 
 
 		 494 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  27.22 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  25.36 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  29.08 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  28.8 
 
 		 495 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  20.88 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  29.08 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  23.08 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  23.08 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  29.08 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.64 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  24.61 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1193  GTPase  33.65 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  25.68 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  25.71 
 
 		 449 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  26.89 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  28.09 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  23.66 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>