182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4719 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.56326e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.13347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.98222e-07  hitchhiker  1.33205e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.87491e-08  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.75023e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.18857e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.06599e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  99.45 
 
 
181 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.95119e-09  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  95.03 
 
 
181 aa  362  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.55346e-06  unclonable  2.09228e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  94.48 
 
 
181 aa  359  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  94.48 
 
 
181 aa  359  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  94.48 
 
 
181 aa  359  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.3917e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  94.48 
 
 
181 aa  359  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  94.48 
 
 
181 aa  359  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  89.5 
 
 
181 aa  344  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.86047e-07  hitchhiker  5.86556e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  91.01 
 
 
180 aa  343  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  89.89 
 
 
180 aa  338  3e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  86.67 
 
 
181 aa  334  4e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  86.11 
 
 
181 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.72044e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  86.11 
 
 
181 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.74416e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  86.52 
 
 
180 aa  329  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  82.12 
 
 
180 aa  317  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  70.72 
 
 
181 aa  282  2e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  69.89 
 
 
184 aa  281  4e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  69.61 
 
 
181 aa  280  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.10797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0628  oligoribonuclease  71.19 
 
 
180 aa  275  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  68.51 
 
 
184 aa  273  8e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  67.96 
 
 
181 aa  269  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.47297e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  67.96 
 
 
181 aa  268  3e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  69.06 
 
 
181 aa  268  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  67.43 
 
 
181 aa  265  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  66.85 
 
 
181 aa  263  9e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  66.3 
 
 
181 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  65.75 
 
 
181 aa  262  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  69.1 
 
 
180 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  69.1 
 
 
180 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07470  oligoribonuclease  69.49 
 
 
180 aa  261  5e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1502  oligoribonuclease  67.4 
 
 
193 aa  261  5e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.678384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  68.54 
 
 
180 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0515  oligoribonuclease  67.98 
 
 
180 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460562  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  65.36 
 
 
180 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  65.19 
 
 
181 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  64.64 
 
 
181 aa  258  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  65.19 
 
 
181 aa  258  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  67.42 
 
 
180 aa  257  5e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  67.42 
 
 
180 aa  257  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  257  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  257  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  257  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  66.85 
 
 
180 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  63.54 
 
 
185 aa  254  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  9.47663e-08 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  61.33 
 
 
181 aa  253  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  68.36 
 
 
178 aa  253  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  64.64 
 
 
181 aa  253  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  253  1e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  253  1e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  63.54 
 
 
181 aa  253  1e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  253  1e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  64.09 
 
 
181 aa  253  1e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3317  oligoribonuclease  61.33 
 
 
181 aa  252  2e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000232212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  67.8 
 
 
178 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  63.84 
 
 
205 aa  250  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2666  oligoribonuclease  64.61 
 
 
187 aa  249  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  64.09 
 
 
183 aa  249  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2797  oligoribonuclease  64.61 
 
 
187 aa  249  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.29 
 
 
183 aa  249  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.3 
 
 
181 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  63.28 
 
 
210 aa  248  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2911  oligoribonuclease  66.3 
 
 
191 aa  247  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  64.37 
 
 
187 aa  245  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  60.67 
 
 
179 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.43 
 
 
188 aa  245  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  61.45 
 
 
219 aa  245  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  62.98 
 
 
181 aa  244  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  64.61 
 
 
187 aa  244  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  64.97 
 
 
219 aa  241  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1320  oligoribonuclease  60.77 
 
 
183 aa  241  4e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1379  oligoribonuclease  60.77 
 
 
183 aa  241  4e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.969782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  59.12 
 
 
183 aa  239  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  61.93 
 
 
206 aa  238  3e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3001  oligoribonuclease  61.45 
 
 
184 aa  238  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217558  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  63.69 
 
 
215 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  60.77 
 
 
182 aa  236  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  59.44 
 
 
182 aa  234  5e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0714  oligoribonuclease  59.44 
 
 
184 aa  234  5e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.705267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  59.22 
 
 
207 aa  234  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  60.23 
 
 
229 aa  234  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  60.69 
 
 
207 aa  233  1e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  59.44 
 
 
195 aa  233  1e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.45931e-11  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  60.22 
 
 
183 aa  233  1e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  58.89 
 
 
195 aa  233  2e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  59.44 
 
 
193 aa  233  2e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  60.12 
 
 
203 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  56.67 
 
 
187 aa  231  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2225  oligoribonuclease  62.5 
 
 
211 aa  230  7e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  56.11 
 
 
187 aa  228  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0958  oligoribonuclease  60.8 
 
 
206 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1037  oligoribonuclease  61.93 
 
 
206 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0954  oligoribonuclease  60.8 
 
 
206 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>