More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4521 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  7.83565e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.83625e-05  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.71893e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  7.94784e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.38759e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  99.45 
 
 
181 aa  366  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  4.7886e-15 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.37761e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  99.45 
 
 
181 aa  366  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.52563e-08  hitchhiker  5.86315e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  99.45 
 
 
181 aa  366  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  99.45 
 
 
181 aa  366  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.26486e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  99.45 
 
 
181 aa  366  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  2.40769e-13 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  6.1444e-09  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.7638e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  97.79 
 
 
181 aa  359  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  97.79 
 
 
181 aa  359  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  97.24 
 
 
181 aa  358  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  97.24 
 
 
181 aa  358  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  96.69 
 
 
181 aa  358  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.56554e-08  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  96.69 
 
 
181 aa  357  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  96.69 
 
 
181 aa  357  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  96.69 
 
 
181 aa  357  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.75303e-08  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  95.58 
 
 
181 aa  354  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.25159e-09  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  86.67 
 
 
182 aa  328  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.95897e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  87.85 
 
 
181 aa  329  2e-89  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  85 
 
 
182 aa  325  1e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  85 
 
 
181 aa  325  2e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.36415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  85 
 
 
182 aa  325  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.18825e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  76.5 
 
 
183 aa  299  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.25102e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  77.9 
 
 
180 aa  297  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.73451e-06  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  76.5 
 
 
183 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.71251e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  77.05 
 
 
183 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.73496e-05  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  77.05 
 
 
183 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.20393e-07  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  77.05 
 
 
183 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  77.05 
 
 
183 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.10017e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  76.7 
 
 
183 aa  294  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.74411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  76.5 
 
 
183 aa  293  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.38288e-08  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  76.5 
 
 
183 aa  291  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.19e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  75.98 
 
 
183 aa  291  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  1.64845e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  74.86 
 
 
183 aa  291  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.5431e-08  hitchhiker  1.91931e-09 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  74.32 
 
 
183 aa  291  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.9225e-06  hitchhiker  4.2395e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  75.96 
 
 
183 aa  290  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.77465e-09  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  76.54 
 
 
190 aa  290  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  4.18183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  75.96 
 
 
183 aa  290  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  75.96 
 
 
183 aa  290  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.71558e-07  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  75.41 
 
 
183 aa  289  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.54051e-06  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  75.28 
 
 
183 aa  286  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  76.7 
 
 
184 aa  283  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  9.30263e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  70.72 
 
 
195 aa  275  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  73.14 
 
 
177 aa  275  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  73.56 
 
 
177 aa  272  1e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.83077e-10  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  72.57 
 
 
177 aa  271  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  72.57 
 
 
177 aa  271  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  271  4e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  271  4e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.10912e-07  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  72.99 
 
 
177 aa  269  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  70.11 
 
 
177 aa  269  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.42135e-09  hitchhiker  1.70909e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  2.84446e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  1.20697e-05  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  2.65262e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  70.69 
 
 
177 aa  266  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  72.99 
 
 
177 aa  266  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  71.43 
 
 
177 aa  265  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  69.71 
 
 
177 aa  260  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.27222e-06  hitchhiker  2.38714e-06 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  69.54 
 
 
177 aa  258  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  67.39 
 
 
186 aa  255  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  5.94191e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06110  transcription termination/antitermination factor NusG  74.52 
 
 
159 aa  251  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  67.24 
 
 
177 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  66.09 
 
 
177 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  9.12407e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  65.22 
 
 
185 aa  246  9e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  63.69 
 
 
193 aa  244  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  63.43 
 
 
177 aa  244  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  63.13 
 
 
193 aa  243  7e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  66.09 
 
 
177 aa  242  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  63.43 
 
 
194 aa  239  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  61.41 
 
 
185 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  61.41 
 
 
185 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  8.22613e-07 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2336  transcription antitermination protein NusG  66.67 
 
 
177 aa  239  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  3.49971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  61.41 
 
 
185 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  64.94 
 
 
177 aa  239  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  3.40936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.649e-05  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  7.38018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  8.47824e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  60.87 
 
 
185 aa  238  3e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  62.86 
 
 
177 aa  238  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  61.58 
 
 
194 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  61.58 
 
 
194 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  63.22 
 
 
177 aa  234  5e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  1.62097e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>