More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4365 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2974  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  65.31 
 
 
726 aa  974  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.2 
 
 
716 aa  825  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4309  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  94.79 
 
 
771 aa  1384  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.956942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4365  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
729 aa  1490  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0869233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1605  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.46 
 
 
721 aa  724  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.36351e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1578  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.57 
 
 
716 aa  784  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.1 
 
 
715 aa  780  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.1 
 
 
715 aa  778  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.06 
 
 
716 aa  854  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3747  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  65.56 
 
 
730 aa  981  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.34 
 
 
717 aa  834  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4262  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  94.65 
 
 
729 aa  1381  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0024  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.62 
 
 
716 aa  841  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00830663  hitchhiker  4.74346e-08 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2534  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  65.73 
 
 
723 aa  949  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.386757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0032  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.98 
 
 
716 aa  826  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58594  normal  0.0455208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16390  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  48.67 
 
 
710 aa  662  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.36 
 
 
715 aa  786  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.64 
 
 
716 aa  850  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5285  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  98.35 
 
 
729 aa  1474  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.427005  normal  0.014724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.92 
 
 
716 aa  853  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56561e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4369  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  94.92 
 
 
771 aa  1384  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4213  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  94.79 
 
 
729 aa  1383  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.42 
 
 
719 aa  743  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0261  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  78.43 
 
 
729 aa  1174  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.86607  normal  0.0441662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0201  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.91 
 
 
719 aa  835  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3606  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.92 
 
 
715 aa  804  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.31 
 
 
727 aa  761  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03736  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.18 
 
 
716 aa  805  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.62 
 
 
716 aa  841  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0281216  hitchhiker  0.000170184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.48 
 
 
716 aa  840  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  0.0928746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.64 
 
 
716 aa  851  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  54.87 
 
 
719 aa  781  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03686  hypothetical protein  99.04 
 
 
729 aa  1476  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.06 
 
 
716 aa  854  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214886  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
715 aa  802  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.281306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.9 
 
 
716 aa  837  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
715 aa  801  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.04 
 
 
729 aa  1480  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00427861  hitchhiker  0.00453732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4069  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  98.77 
 
 
729 aa  1475  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  56.78 
 
 
721 aa  802  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4164  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.31 
 
 
729 aa  1480  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.48 
 
 
716 aa  841  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.06 
 
 
716 aa  853  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000906563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3933  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  77.34 
 
 
729 aa  1138  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
722 aa  806  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00460  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  66.01 
 
 
723 aa  949  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2136  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
715 aa  808  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434411  normal  0.123544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4135  fatty oxidation complex, alpha subunit FadB  99.04 
 
 
729 aa  1477  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0019  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.08 
 
 
716 aa  861  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00182619  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03737  fused 3-hydroxybutyryl-CoA epimerase/delta(3)-cis-delta(2)-trans-enoyl-CoA isomerase/enoyl-CoA hydratase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  99.04 
 
 
729 aa  1476  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3290  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.06 
 
 
721 aa  803  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0906182  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  77.34 
 
 
729 aa  1138  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.97 
 
 
719 aa  750  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  67.32 
 
 
729 aa  998  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.64 
 
 
715 aa  796  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1144  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
715 aa  830  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00169331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4044  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  75.94 
 
 
729 aa  1129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4316  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.31 
 
 
729 aa  1480  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.54826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1580  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.08 
 
 
715 aa  779  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120976  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  77.34 
 
 
729 aa  1137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.34 
 
 
716 aa  858  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000142726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4234  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  75.52 
 
 
729 aa  1122  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.535693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001988  fatty oxidation complex alpha subunit FadB  66.99 
 
 
723 aa  955  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4190  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  95.06 
 
 
729 aa  1388  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0458015  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3949  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  92.87 
 
 
729 aa  1359  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.706953  normal  0.0634882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1395  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  45.33 
 
 
715 aa  595  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1660  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  47.28 
 
 
722 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2350  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  44.57 
 
 
711 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702817  normal  0.449344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.06 
 
 
724 aa  455  1e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0565  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.19 
 
 
708 aa  415  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.486274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  36.56 
 
 
714 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.29 
 
 
744 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  34.8 
 
 
717 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.13 
 
 
723 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1629  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.5 
 
 
715 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.895951  normal  0.0132209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.37 
 
 
719 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.6 
 
 
706 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  5.61354e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.31 
 
 
714 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2760  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.46 
 
 
706 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2167  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.27 
 
 
706 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359385  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002857  fatty oxidation complex alpha subunit FadJ  35.03 
 
 
703 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1530  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.55 
 
 
708 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2459  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.73 
 
 
706 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.740158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2780  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.46 
 
 
706 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.77 
 
 
752 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2855  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.05 
 
 
706 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.53 
 
 
706 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1473  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.41 
 
 
709 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.451706  normal  0.0332103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3088  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.55 
 
 
707 aa  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3026  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.35 
 
 
713 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144673  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1461  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.16 
 
 
709 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22255e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.47 
 
 
727 aa  379  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03120  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  34.89 
 
 
704 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.28 
 
 
709 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.682572  hitchhiker  0.000547588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.14 
 
 
715 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1341  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  33.89 
 
 
732 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.83 
 
 
710 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2528  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.29 
 
 
715 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  34.6 
 
 
721 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2742  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.29 
 
 
715 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>