More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4249 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03617  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.404917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4234  ATP synthase F1, gamma subunit  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4261  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114644  normal  0.0774581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03561  hypothetical protein  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.301672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4101  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.631159  normal  0.145775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5169  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  hitchhiker  0.00895042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3949  F0F1 ATP synthase subunit gamma  99.65 
 
 
287 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.060401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4249  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
287 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000401415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.86 
 
 
287 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.86 
 
 
287 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.86 
 
 
287 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.86 
 
 
287 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  96.86 
 
 
287 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  92.68 
 
 
287 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  90.94 
 
 
287 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  91.64 
 
 
287 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  90.94 
 
 
287 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  91.29 
 
 
287 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  90.94 
 
 
287 aa  541  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  90.94 
 
 
287 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3992  F0F1 ATP synthase subunit gamma  89.55 
 
 
287 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  89.55 
 
 
287 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.35 
 
 
288 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.17 
 
 
286 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.17 
 
 
286 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.17 
 
 
286 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.47 
 
 
286 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.17 
 
 
286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.87 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  74.22 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.52 
 
 
286 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.13 
 
 
286 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.13 
 
 
286 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.13 
 
 
286 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.13 
 
 
286 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.13 
 
 
286 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  72.22 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.43 
 
 
286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  72.57 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.08 
 
 
286 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.08 
 
 
286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.83 
 
 
288 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.99 
 
 
286 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.69 
 
 
287 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  68.64 
 
 
286 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.69 
 
 
286 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.69 
 
 
286 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.69 
 
 
287 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0142  ATP synthase F1, gamma subunit  67.6 
 
 
287 aa  423  1e-117  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.34 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  69.34 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.94 
 
 
287 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  66.55 
 
 
286 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.99 
 
 
286 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.94 
 
 
286 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3967  F0F1 ATP synthase subunit gamma  66.9 
 
 
286 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0127886  normal  0.423609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  67.25 
 
 
286 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.29 
 
 
286 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3731  ATP synthase F1, gamma subunit  68.4 
 
 
288 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  64.81 
 
 
287 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  68.29 
 
 
286 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  67.94 
 
 
286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.71 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  61.67 
 
 
286 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  63.1 
 
 
289 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.81 
 
 
287 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.25 
 
 
289 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3285  ATP synthase F1, gamma subunit  63.36 
 
 
292 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.21 
 
 
288 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.21 
 
 
288 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  63.41 
 
 
286 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.25 
 
 
293 aa  374  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.17 
 
 
290 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.38 
 
 
287 aa  371  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.88 
 
 
293 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.88 
 
 
293 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.86 
 
 
289 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.86 
 
 
289 aa  368  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.29 
 
 
287 aa  364  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.33 
 
 
287 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  59.44 
 
 
287 aa  360  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0011  ATP synthase F1, gamma subunit  61.67 
 
 
287 aa  358  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.99 
 
 
287 aa  357  9e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.73 
 
 
291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.73 
 
 
291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.73 
 
 
291 aa  352  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.04 
 
 
291 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.46 
 
 
291 aa  348  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.29 
 
 
288 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.29 
 
 
288 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  55.9 
 
 
288 aa  347  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 
288 aa  345  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.98 
 
 
288 aa  345  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.55 
 
 
290 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.25 
 
 
288 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.24 
 
 
293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  56.06 
 
 
288 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  56.7 
 
 
291 aa  342  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  55.1 
 
 
291 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>