216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4174 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03550  sugar phosphate antiporter  100 
 
 
463 aa  933    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0037  phosphoglycerate transporter  100 
 
 
463 aa  933    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4013  sugar phosphate antiporter  95.68 
 
 
463 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3997  sugar phosphate antiporter  95.68 
 
 
463 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0033  sugar phosphate antiporter  99.78 
 
 
463 aa  931    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4031  sugar phosphate antiporter  99.78 
 
 
463 aa  932    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.505576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4176  sugar phosphate antiporter  95.68 
 
 
463 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4253  sugar phosphate antiporter  99.78 
 
 
463 aa  932    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5096  sugar phosphate antiporter  100 
 
 
463 aa  933    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0505973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4118  sugar phosphate antiporter  95.68 
 
 
463 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0030  sugar phosphate antiporter  93.3 
 
 
463 aa  844    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.668761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03492  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  933    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000092  hexose phosphate transport protein  82.11 
 
 
442 aa  716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.149187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3501  sugar phosphate antiporter  92.01 
 
 
463 aa  849    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.547984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3879  sugar phosphate antiporter  100 
 
 
463 aa  933    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4174  sugar phosphate antiporter  100 
 
 
463 aa  933    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4068  sugar phosphate antiporter  95.68 
 
 
463 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  51.08 
 
 
459 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  51.08 
 
 
459 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  35.11 
 
 
445 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  35.11 
 
 
445 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  34.3 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  33.12 
 
 
449 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  32.9 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  32.9 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  32.9 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  32.9 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  32.9 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  33.12 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  32.9 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 
449 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  31.11 
 
 
446 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  32.15 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  32.54 
 
 
463 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  32.54 
 
 
463 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.73 
 
 
452 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  32.9 
 
 
463 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  32.9 
 
 
463 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.56 
 
 
483 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  32.9 
 
 
463 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  32.15 
 
 
444 aa  216  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.29 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  32.15 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.29 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  31.45 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.7 
 
 
452 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  32.52 
 
 
449 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.7 
 
 
452 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.7 
 
 
452 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.7 
 
 
452 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.7 
 
 
452 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  32.16 
 
 
444 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  32.16 
 
 
444 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  30.9 
 
 
481 aa  211  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  34.29 
 
 
446 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  30.68 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  30.91 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  32.16 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  30.68 
 
 
444 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.29 
 
 
449 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  30.68 
 
 
444 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.61 
 
 
457 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  32.11 
 
 
445 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.19 
 
 
449 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.54 
 
 
452 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.28 
 
 
449 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  33.71 
 
 
454 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.46 
 
 
448 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.6 
 
 
451 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.46 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.19 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 
455 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.42 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  34.68 
 
 
452 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  34.68 
 
 
452 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  31.99 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.58 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.03 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  34.1 
 
 
456 aa  194  3e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.3 
 
 
450 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  33.05 
 
 
439 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  33.05 
 
 
439 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  33.05 
 
 
439 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  33.05 
 
 
439 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  33.05 
 
 
439 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  33.05 
 
 
439 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  33.05 
 
 
439 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  33.05 
 
 
439 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  32.83 
 
 
439 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  31.39 
 
 
446 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  34.2 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  31.98 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>