176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3900 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  100 
 
 
276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  99.28 
 
 
276 aa  557  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  99.64 
 
 
276 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  89.13 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  89.13 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  89.13 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  89.05 
 
 
274 aa  510  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  89.05 
 
 
274 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  80.43 
 
 
276 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  57.3 
 
 
277 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  56.32 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  56.3 
 
 
278 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  57.45 
 
 
274 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  54.18 
 
 
278 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  54.18 
 
 
278 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  54.3 
 
 
259 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  54.87 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  42.86 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  44.29 
 
 
280 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  43.93 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  41.32 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  43.77 
 
 
280 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  41.28 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  43.01 
 
 
277 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  40 
 
 
281 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  43.55 
 
 
283 aa  215  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  43.21 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  42.34 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  40.15 
 
 
281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  39.29 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  40.15 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  39.93 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  42.12 
 
 
276 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  42.2 
 
 
280 aa  202  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  40.14 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  39.49 
 
 
278 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  39.27 
 
 
278 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  37.18 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  34.92 
 
 
292 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  34.36 
 
 
287 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  34.26 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  32.03 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  30.03 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  32.58 
 
 
290 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  34.08 
 
 
286 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  31.09 
 
 
284 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  29.7 
 
 
289 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  32.42 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  34.46 
 
 
286 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  39.04 
 
 
224 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  28.87 
 
 
295 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  28.72 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  28.17 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  38.1 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  27.92 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  29.33 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  29.43 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.93 
 
 
356 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  24.91 
 
 
396 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  28.65 
 
 
207 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  26.18 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  29.79 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  22.84 
 
 
486 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  31.65 
 
 
430 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  26.04 
 
 
342 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  27.54 
 
 
348 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  26.32 
 
 
226 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  29.22 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  25.25 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  26.46 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.55 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  31.34 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  29.23 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  30.16 
 
 
389 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  39.74 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  26.7 
 
 
376 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.6 
 
 
303 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  28.8 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  25.57 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  29.13 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  26.4 
 
 
386 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  27.92 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  24 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  30.82 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  33.33 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  24 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.6 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.22 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  34.52 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  27.7 
 
 
513 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  26.92 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  23.37 
 
 
360 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>