44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3483 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02887  predicted outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0682  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3299  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.117538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3443  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3483  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3193  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02837  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0685  putative lipoprotein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4326  putative outer membrane lipoprotein  98.82 
 
 		 85 aa  173  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3344  putative outer membrane lipoprotein  66.23 
 
 		 77 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1767  LPP repeat-containing protein  50 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000800001  unclonable  0.00000127827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2186  LPP repeat-containing protein  48.61 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000306733  hitchhiker  0.000000305308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1965  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000537115  decreased coverage  0.000000000167771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1794  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000710111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1474  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000804906  normal  0.0109348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1510  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000917327  hitchhiker  0.00000000217872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1490  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000317688  hitchhiker  0.0000000000000124306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2442  LPP repeat-containing protein  50 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000387277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2745  LPP repeat-containing protein  50 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000753676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1854  LPP repeat-containing protein  50 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000796453  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2583  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000315895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1748  major outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.4636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1519  major outer membrane lipoprotein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000133689  decreased coverage  0.000000000978616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01646  murein lipoprotein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000290635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1965  LPP repeat-containing protein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.12979e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01636  hypothetical protein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2391  major outer membrane lipoprotein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000996739  decreased coverage  0.0000025912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1758  major outer membrane lipoprotein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.20557e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1893  major outer membrane lipoprotein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000101718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1878  major outer membrane lipoprotein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1954  LPP repeat-containing protein  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000368464  unclonable  0.00000000844814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1473  hypothetical protein  50.77 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000926239  normal  0.022042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1795  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000258833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1489  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000483373  hitchhiker  0.000000000000889895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1966  hypothetical protein  49.23 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000559478  hitchhiker  0.00000000139787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1508  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0719392  hitchhiker  0.00000000192461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1663  LPP repeat-containing protein  44.29 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000205201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1701  LPP repeat-containing protein  44.29 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000609145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2985  major outer membrane lipoprotein, putative  32.91 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2623  major outer membrane lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0202513  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1198  major outer membrane lipoprotein, putative  31.65 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1154  major outer membrane lipoprotein, putative  31.65 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0547044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1231  major outer membrane lipoprotein, putative  31.65 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.942856  normal  0.491239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3159  major outer membrane lipoprotein, putative  31.65 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.764364  normal  0.139344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>