17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3405 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4799  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3405  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3204  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1387  regulatory protein DeoR  44.93 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2884  regulatory protein DeoR  44.93 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3434  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0758  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1041  putative transcriptional regulator  42.92 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  28.57 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3355  transcriptional regulator protein-like protein  66.13 
 
 		 285 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.41 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  30 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  27 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4729  regulatory protein DeoR  24.88 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0826  aspartate ammonia-lyase  23.12 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00181727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>