50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3330 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  885    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  59.72 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  88.15 
 
 		 273 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  87.79 
 
 		 267 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  43.37 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  40.38 
 
 		 438 aa  306  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  37.59 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  34.62 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  35.42 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  36.08 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  36.08 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  34.06 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  35.77 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  34.16 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  33.42 
 
 		 422 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  34.91 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  33.15 
 
 		 443 aa  176  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  32.29 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  35.69 
 
 		 288 aa  147  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  27.44 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  30.34 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.46 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  25.68 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  26.91 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.4 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.04 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.56 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.54 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  22.2 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.19 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  23.72 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  25.57 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  24.81 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  31.71 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.03 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  28.37 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  23.33 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0230  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.07 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  33.77 
 
 		 164 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  23.7 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0026  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.61 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.579056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2839  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  25.71 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  24.52 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.57 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0972  hypothetical protein  26.03 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.241373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  23.94 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1910  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  25.61 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0879  hypothetical protein  22.13 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0515666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3753  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  20.61 
 
 		 351 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.537146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>