119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3126 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  50.46 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  50.46 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  50.46 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  49.54 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  50.24 
 
 		 228 aa  194  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  43.75 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  40.83 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  35.75 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  34.31 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  29.73 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  30.22 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  30.22 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  28.78 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  30.6 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  32.56 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  27.34 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  26.57 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  29.81 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  25.87 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  34.38 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  34.38 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  24.77 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  30.71 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.78 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  26.57 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  27.54 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.85 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.66 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  30.69 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  30.23 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  25.9 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  27.48 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  30.23 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.85 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  26.85 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  26.85 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  27.39 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  33.71 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  29.46 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  30.23 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  29.08 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  34 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  26.36 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.46 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  26.75 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  33.65 
 
 		 434 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  26.75 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  28.43 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  28.43 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  26.52 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  24.5 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  34.69 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  32.69 
 
 		 432 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  28.28 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  28.28 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 456 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.78 
 
 		 442 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  28.89 
 
 		 405 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  27.66 
 
 		 430 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  26.79 
 
 		 431 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  28.69 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  25.93 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  27.1 
 
 		 437 aa  45.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  24.46 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  28.71 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  25.63 
 
 		 469 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  28.09 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  25 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  24.59 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  24.07 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  34.18 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  27.72 
 
 		 571 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  24.76 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  27.72 
 
 		 571 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  27.72 
 
 		 552 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  27.72 
 
 		 560 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.72 
 
 		 552 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.72 
 
 		 552 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  27.72 
 
 		 552 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  30.89 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  24.76 
 
 		 421 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>