117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3113 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02658  conserved inner membrane protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02619  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4071  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.89179e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0905  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3063  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.47901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3113  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.03813e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2948  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  255  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.25789e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  91.6 
 
 
131 aa  240  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  90.08 
 
 
131 aa  238  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  90.08 
 
 
131 aa  238  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  90.08 
 
 
131 aa  238  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  90.08 
 
 
131 aa  238  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  90.08 
 
 
131 aa  238  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  80.15 
 
 
131 aa  218  2e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  78.63 
 
 
131 aa  216  9e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  75.57 
 
 
131 aa  204  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  1.90492e-08 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  73.81 
 
 
128 aa  193  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  76.19 
 
 
128 aa  186  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3220  hypothetical protein  71.76 
 
 
131 aa  183  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.58769e-06  normal  0.085571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1000  hypothetical protein  71.76 
 
 
131 aa  183  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.79466e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1053  hypothetical protein  71.76 
 
 
131 aa  183  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1031  hypothetical protein  40.5 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0440942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  33.6 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  37.21 
 
 
132 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.39124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2201  hypothetical protein  38.66 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  45 
 
 
123 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  37.21 
 
 
132 aa  82.8  1e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  44.26 
 
 
125 aa  82.8  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  45.08 
 
 
125 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  81.6  3e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  45 
 
 
123 aa  80.5  7e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  45 
 
 
123 aa  80.5  7e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  46.72 
 
 
128 aa  80.5  7e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  79.3  2e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3469  hypothetical protein  41.53 
 
 
129 aa  77  8e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  hitchhiker  0.000383928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  39.84 
 
 
126 aa  76.6  9e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  40.83 
 
 
126 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2407  hypothetical protein  43.59 
 
 
128 aa  75.5  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  40.68 
 
 
129 aa  75.5  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1391  hypothetical protein  42.02 
 
 
130 aa  74.7  4e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.129642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1352  hypothetical protein  42.02 
 
 
130 aa  74.7  4e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.679146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1366  hypothetical protein  42.02 
 
 
130 aa  74.7  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0307163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2994  protein of unknown function DUF423  42.02 
 
 
130 aa  74.7  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103925  hitchhiker  1.55548e-06 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0895  protein of unknown function DUF423  40.19 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1284  hypothetical protein  41.18 
 
 
130 aa  73.9  7e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00814173  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4023  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  73.2  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  38.89 
 
 
126 aa  72.4  2e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2427  hypothetical protein  40.59 
 
 
128 aa  72.4  2e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2781  hypothetical protein  40.35 
 
 
126 aa  72.4  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1549  protein of unknown function DUF423  41.22 
 
 
127 aa  72  3e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  35.4 
 
 
122 aa  70.9  5e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  34.84 
 
 
159 aa  70.9  6e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  40.54 
 
 
123 aa  70.1  9e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1535  hypothetical protein  41.35 
 
 
130 aa  68.6  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3593  hypothetical protein  38.21 
 
 
123 aa  69.3  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.00464e-13  normal  0.124416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  36.59 
 
 
127 aa  68.6  3e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02960  hypothetical protein  44.07 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  41.12 
 
 
129 aa  68.6  3e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2722  hypothetical protein  41.35 
 
 
130 aa  68.2  4e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.62987e-05  normal  0.0799022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2892  hypothetical protein  41.35 
 
 
130 aa  67.8  5e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.89686e-06  hitchhiker  4.82381e-06 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  37.19 
 
 
125 aa  67.4  6e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  67.4  6e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3505  hypothetical protein  36.67 
 
 
132 aa  67  8e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2793  hypothetical protein  41.35 
 
 
130 aa  67  8e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00315578  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0764  hypothetical protein  39.32 
 
 
159 aa  66.6  1e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630879  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6267  protein of unknown function DUF423  34.4 
 
 
131 aa  66.6  1e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015945  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3368  protein of unknown function DUF423  34.17 
 
 
123 aa  65.5  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00388391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1603  hypothetical protein  44.23 
 
 
126 aa  65.9  2e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  33.33 
 
 
125 aa  65.9  2e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5185  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  64.7  4e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5073  hypothetical protein  31.09 
 
 
122 aa  64.7  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000730403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5521  hypothetical protein  33.88 
 
 
122 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5090  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5515  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5487  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5436  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  64.3  5e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3413  hypothetical protein  38.89 
 
 
126 aa  64.7  5e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5571  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  63.9  6e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0620  hypothetical protein  31.09 
 
 
122 aa  63.9  7e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0606  hypothetical protein  31.09 
 
 
122 aa  63.9  7e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5243  hypothetical protein  36.45 
 
 
122 aa  63.9  8e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01660  hypothetical protein  33.83 
 
 
129 aa  63.9  8e-10  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.228945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5642  hypothetical protein  36.45 
 
 
122 aa  63.9  8e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1365  hypothetical protein  32.06 
 
 
128 aa  63.2  1e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02564  uncharacterized small membrane protein  36.84 
 
 
141 aa  63.5  1e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00480554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3149  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  62.8  1e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08455  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  63.2  1e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  34.86 
 
 
137 aa  62.8  1e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2563  hypothetical protein  32.77 
 
 
133 aa  62.8  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1903  protein of unknown function DUF423  35.92 
 
 
124 aa  62  3e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4139  protein of unknown function DUF423  47.06 
 
 
124 aa  61.6  3e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4165  protein of unknown function DUF423  47.06 
 
 
124 aa  61.2  5e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.385275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4914  protein of unknown function DUF423  35.25 
 
 
124 aa  61.2  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3477  protein of unknown function DUF423  32.5 
 
 
123 aa  60.5  7e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0402  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  60.5  8e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.151461  hitchhiker  0.000250509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  39.05 
 
 
125 aa  59.3  1e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0226  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  58.5  3e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>