82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3112 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02657  predicted methyltransferase  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3125  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  94.26 
 
 
366 aa  733  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.38334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3142  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  94.26 
 
 
366 aa  734  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0783039  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3190  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  93.99 
 
 
366 aa  734  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.580308  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3205  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  94.26 
 
 
366 aa  734  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3064  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  99.73 
 
 
366 aa  763  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.57205e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2947  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.10628e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3112  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.30243e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0906  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3305  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  93.99 
 
 
366 aa  734  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.571863  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2950  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.23622e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3252  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  89.62 
 
 
366 aa  697  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.225665  normal  0.903193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4070  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.74356e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02618  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0882  conserved hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  765  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2992  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  77.87 
 
 
366 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3219  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.08 
 
 
368 aa  609  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  7.91022e-07  normal  0.0810678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0929  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  75.96 
 
 
366 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.088881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1054  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.08 
 
 
368 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1001  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  78.08 
 
 
368 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.13251e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3375  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  75.68 
 
 
366 aa  603  1e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3803  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  76.5 
 
 
367 aa  603  1e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0270508  hitchhiker  4.65668e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3176  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  75.41 
 
 
366 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0693  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  63.59 
 
 
363 aa  493  1e-138  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.716543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004249  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase mtfA  63.1 
 
 
363 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  9.17276e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01186  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  62.54 
 
 
363 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2721  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  60.06 
 
 
361 aa  451  1e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.44468e-08  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1285  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.49 
 
 
361 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.07001e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2792  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  60.06 
 
 
361 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  5.90307e-06  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2891  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.77 
 
 
361 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.17947e-06  hitchhiker  8.24021e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1353  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.21 
 
 
361 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2993  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.21 
 
 
361 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0309366  hitchhiker  2.41621e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1392  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.21 
 
 
361 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1367  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.21 
 
 
361 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2426  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  60.62 
 
 
361 aa  446  1e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1536  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  59.21 
 
 
361 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2981  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  58.92 
 
 
360 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2761  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  58.36 
 
 
363 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0290768  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2780  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  57.1 
 
 
362 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2562  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  56.09 
 
 
367 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3468  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  56.37 
 
 
358 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0401954  hitchhiker  0.000523336 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0496  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  56.27 
 
 
361 aa  417  1e-115  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1613  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  53.52 
 
 
365 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.09552  normal  0.605694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3319  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  54.11 
 
 
360 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.045342  normal  0.821385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2200  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  52.53 
 
 
356 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3541  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  50.41 
 
 
368 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20050  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  51.83 
 
 
353 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2017  hypothetical protein  48.76 
 
 
357 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3403  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 
357 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1904  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  50.56 
 
 
351 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000223695  normal  0.490603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2113  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.01 
 
 
354 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3626  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.01 
 
 
354 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1655  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.01 
 
 
354 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0111159  normal  0.447876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1632  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.89 
 
 
355 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.281691  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44280  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.58 
 
 
352 aa  329  5e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3889  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.17 
 
 
366 aa  326  4e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.040112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3767  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.3 
 
 
352 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1930  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.16 
 
 
350 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.857797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0092  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.41 
 
 
352 aa  316  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2412  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.4 
 
 
357 aa  307  2e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02563  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.42 
 
 
365 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00506422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1153  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.7 
 
 
349 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1151  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.1 
 
 
364 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  hitchhiker  6.80038e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1781  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.61 
 
 
358 aa  295  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04620  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.07 
 
 
347 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1647  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.44 
 
 
435 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.092844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0678  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.09 
 
 
355 aa  275  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2090  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  41.76 
 
 
351 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2011  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  41.48 
 
 
366 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.989087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1490  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.05 
 
 
360 aa  239  6e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.624039  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1661  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  40.17 
 
 
337 aa  236  5e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1789  hypothetical protein  40.94 
 
 
344 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50496  predicted protein  28.28 
 
 
504 aa  73.2  6e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2347  hypothetical protein  30.99 
 
 
310 aa  68.6  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0643  hypothetical protein  29.69 
 
 
304 aa  67.4  4e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0659  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  65.1  2e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0304  hypothetical protein  30.16 
 
 
303 aa  65.1  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.222321  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0307  hypothetical protein  29.01 
 
 
308 aa  63.9  4e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3257  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase MtfA  28.21 
 
 
335 aa  63.9  5e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4304  THUMP domain-containing protein  29.9 
 
 
354 aa  61.6  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2541  hypothetical protein  25.81 
 
 
314 aa  57.4  3e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00453654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  33.62 
 
 
240 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>