69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3058 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  95.83 
 
 
216 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  94.44 
 
 
216 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  94.44 
 
 
216 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  77.31 
 
 
216 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  76.85 
 
 
216 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  75 
 
 
216 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  45.54 
 
 
215 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  41.03 
 
 
235 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  41.45 
 
 
234 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  42.15 
 
 
224 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  39.04 
 
 
230 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.19 
 
 
222 aa  157  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  40.49 
 
 
215 aa  157  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.04 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.67 
 
 
224 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.24 
 
 
225 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.16 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.33 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.24 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.61 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.67 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.36 
 
 
292 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.21 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.41 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  41.41 
 
 
273 aa  72  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.52 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.27 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.97 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.19 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.77 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.28 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.9 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  31.29 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.31 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.8 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.11 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0617652 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.4 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.77 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.94 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  30.82 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.58 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  23.87 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  23.25 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.54 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.17 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2233  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.37 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.49 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.74 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.51 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  25.82 
 
 
275 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.62 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0783  CRISPR-associated CT1974 family protein  26 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.89 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.67 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  25.82 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.62 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.95 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.11 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.79 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.86 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0485  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.92 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.363464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0931  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.58 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.37 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.39 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3219  CRISPR-associated protein  27.11 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0783  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.08 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.29 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>