More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2868 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  99.71 
 
 
345 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  99.71 
 
 
345 aa  713    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  99.71 
 
 
345 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  100 
 
 
345 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  99.71 
 
 
345 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  99.71 
 
 
345 aa  713    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  99.71 
 
 
345 aa  713    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  99.71 
 
 
345 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  87.25 
 
 
345 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  87.25 
 
 
345 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  87.25 
 
 
345 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  87.25 
 
 
345 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  86.96 
 
 
345 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  76.44 
 
 
365 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  63.23 
 
 
349 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  60.31 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  63.86 
 
 
366 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  59.33 
 
 
383 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  59.22 
 
 
382 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  58.65 
 
 
397 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  59.59 
 
 
388 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  58.29 
 
 
395 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  39.7 
 
 
333 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  41.63 
 
 
364 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.83 
 
 
278 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  38.3 
 
 
240 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.84 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  31.17 
 
 
250 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  27.52 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.88 
 
 
652 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.25 
 
 
250 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  29.83 
 
 
248 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  28.74 
 
 
248 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  28.63 
 
 
250 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  28.34 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  27.94 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.05 
 
 
246 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  28.99 
 
 
248 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  31.6 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  27.5 
 
 
248 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.98 
 
 
246 aa  93.2  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.57 
 
 
246 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.57 
 
 
246 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.57 
 
 
246 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.64 
 
 
246 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.75 
 
 
246 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  29.46 
 
 
255 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 
247 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.05 
 
 
246 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.24 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.46 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.51 
 
 
246 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  30.17 
 
 
251 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.56 
 
 
251 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  27.39 
 
 
536 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  30.71 
 
 
247 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.44 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  30.33 
 
 
247 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.1 
 
 
246 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  29.8 
 
 
245 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  30.08 
 
 
245 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.14 
 
 
250 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.93 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.85 
 
 
243 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.75 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  28.75 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.05 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.51 
 
 
247 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  28.75 
 
 
247 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.29 
 
 
542 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.24 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.51 
 
 
247 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.63 
 
 
261 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.87 
 
 
245 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.33 
 
 
247 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.61 
 
 
232 aa  87  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.35 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.11 
 
 
246 aa  86.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  30.65 
 
 
242 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  27.39 
 
 
251 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  28.57 
 
 
252 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.91 
 
 
251 aa  86.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.43 
 
 
243 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.44 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.43 
 
 
243 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.43 
 
 
243 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.35 
 
 
348 aa  86.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.63 
 
 
246 aa  86.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  28.74 
 
 
246 aa  85.9  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.34 
 
 
243 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.4 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.75 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25.42 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.89 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.05 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.28 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.88 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.33 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.33 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.33 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>