144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2804 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  99.09 
 
 
1653 aa  3335    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  99.21 
 
 
1653 aa  3339    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.97 
 
 
1633 aa  1688    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.93 
 
 
1697 aa  910    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  37.67 
 
 
1665 aa  1093    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  53.28 
 
 
1649 aa  1691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  53.64 
 
 
1652 aa  1680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  35.35 
 
 
1727 aa  955    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  81.55 
 
 
1644 aa  2772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  81.87 
 
 
1646 aa  2780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  35.2 
 
 
1637 aa  969    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  81.73 
 
 
1644 aa  2780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  81.91 
 
 
1644 aa  2782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  36.02 
 
 
1635 aa  921    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  78.88 
 
 
1650 aa  2677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.76 
 
 
1664 aa  1696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.09 
 
 
1633 aa  1684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  98.91 
 
 
1653 aa  3333    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.43 
 
 
1619 aa  840    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.9 
 
 
1641 aa  870    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  99.33 
 
 
1653 aa  3343    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  99.03 
 
 
1653 aa  3335    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
1653 aa  3366    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  63.36 
 
 
1663 aa  2072    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.34 
 
 
1632 aa  1680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  99.03 
 
 
1653 aa  3335    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  99.09 
 
 
1653 aa  3335    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  98.49 
 
 
1652 aa  3296    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.09 
 
 
1633 aa  1664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  34.96 
 
 
1641 aa  874    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.33 
 
 
1765 aa  589  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  31.44 
 
 
1758 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.52 
 
 
1832 aa  572  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.58 
 
 
1768 aa  562  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  30.3 
 
 
1805 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  30.83 
 
 
1839 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.94 
 
 
1823 aa  553  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.84 
 
 
1768 aa  549  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.7 
 
 
1782 aa  550  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.14 
 
 
1835 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.67 
 
 
1824 aa  546  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  30.41 
 
 
1737 aa  540  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  30.65 
 
 
1737 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  30.04 
 
 
1737 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.41 
 
 
1772 aa  536  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.26 
 
 
1772 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  29.88 
 
 
1759 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.88 
 
 
1737 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  30.38 
 
 
1743 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  30.19 
 
 
1739 aa  522  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  29.49 
 
 
1815 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  29.52 
 
 
1803 aa  505  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  29.32 
 
 
1808 aa  500  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  29.39 
 
 
1738 aa  499  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.46 
 
 
1808 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.57 
 
 
1808 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  26.63 
 
 
1744 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.26 
 
 
1621 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.65 
 
 
1833 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.85 
 
 
1682 aa  436  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.7 
 
 
1823 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  23.78 
 
 
1807 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.7 
 
 
1785 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2253  hypothetical protein  25.94 
 
 
1569 aa  345  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1900  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.94 
 
 
1828 aa  345  5.999999999999999e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.83 
 
 
1859 aa  318  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.03 
 
 
1864 aa  304  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.29 
 
 
1819 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1501  alpha-2-macroglobulin family N-terminal region domain protein  21.71 
 
 
1761 aa  300  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.4 
 
 
1895 aa  270  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.72 
 
 
1824 aa  267  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.86 
 
 
1872 aa  265  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.81 
 
 
1872 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.81 
 
 
1872 aa  259  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  24.38 
 
 
1925 aa  258  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.18 
 
 
1854 aa  254  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  24.18 
 
 
1898 aa  243  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  22.5 
 
 
1834 aa  242  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  22.36 
 
 
1921 aa  240  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  22.56 
 
 
1921 aa  237  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.49 
 
 
1992 aa  228  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.3 
 
 
1992 aa  228  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.35 
 
 
1998 aa  226  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  24.72 
 
 
2002 aa  224  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.19 
 
 
2000 aa  212  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  24.04 
 
 
2000 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.04 
 
 
2000 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.59 
 
 
1872 aa  206  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.48 
 
 
1821 aa  198  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  22.51 
 
 
1717 aa  193  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1253  alpha-2-macroglobulin family protein  22.11 
 
 
1707 aa  171  8e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.61 
 
 
2195 aa  164  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.11 
 
 
2002 aa  154  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.58 
 
 
1737 aa  152  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.39 
 
 
2002 aa  149  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.07 
 
 
1897 aa  147  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.42 
 
 
2191 aa  147  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.7 
 
 
1916 aa  135  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  21.78 
 
 
1974 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.62 
 
 
1971 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>