24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2777 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  98.89 
 
 		 360 bp  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  99.44 
 
 		 360 bp  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  99.17 
 
 		 360 bp  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  99.44 
 
 		 360 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  98.06 
 
 		 360 bp  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1181  arsenate reductase  99.44 
 
 		 360 bp  690    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2777    100 
 
 		 359 bp  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00159816  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  99.44 
 
 		 360 bp  690    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  99.44 
 
 		 360 bp  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  89.16 
 
 		 360 bp  93.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  89.16 
 
 		 360 bp  93.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  84.55 
 
 		 360 bp  83.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  86.75 
 
 		 360 bp  77.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  86.75 
 
 		 360 bp  77.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  93.33 
 
 		 372 bp  65.9  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  89.58 
 
 		 360 bp  56  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  94.29 
 
 		 351 bp  54  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  94.29 
 
 		 351 bp  54  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  91.43 
 
 		 351 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>