13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2695 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2695  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  215  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.11518e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2772  hypothetical protein  99.12 
 
 
113 aa  211  4e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.4375e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02307  conserved hypothetical protein  97.35 
 
 
113 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.54731e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1271  hypothetical protein  97.35 
 
 
113 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.74632e-08  hitchhiker  0.00144194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02268  hypothetical protein  97.35 
 
 
113 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.51341e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2542  hypothetical protein  97.35 
 
 
113 aa  188  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.90967e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3639  hypothetical protein  95.58 
 
 
113 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.32585e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2935  hypothetical protein  54.93 
 
 
113 aa  60.8  6e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00149974  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1323  hypothetical protein  43.55 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.61887e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1434  hypothetical protein  43.55 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00170755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2742  hypothetical protein  41.94 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.10671e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2070  hypothetical protein  41.89 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2077  conserved hypothetical protein  41.89 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0041669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>